| 查看: 592 | 回复: 2 | ||
[求助]
gromacs新手,md之后,为什么提不出来结构呢? 已有1人参与
|
|
我使用Gromacs跑的md,想取出一些能量较低点的结构 使用的命令是: trjconv -f XX.xtc -s XX.tpr -b X -e X -o X.gro 然后选择group(1), 显示如下: Will write gro: Coordinate file in Gromos-87 format Reading file md.tpr, VERSION 4.6.5 (double precision) Reading file md.tpr, VERSION 4.6.5 (double precision) Select group for output Group 0 ( System) has 29 elements Group 1 ( Other) has 29 elements Group 2 ( H2SO4) has 7 elements Group 3 ( h2o) has 9 elements Group 4 ( tma) has 13 elements Select a group: 1 Selected 1: 'Other' Last frame -1 time 0.000 Precision of traj.xtc is 0.001 (nm) Using output precision of 0.001 (nm) WARNING no output, last frame read at t=95.8 gcq#76: "It Costs Too Much If It Costs a Lot" (Magnapop) 这是什么问题呢??求高手帮助! |
» 猜你喜欢
同年申请2项不同项目,第1个项目里不写第2个项目的信息,可以吗
已经有6人回复
依托企业入选了国家启明计划青年人才。有无高校可以引进的。
已经有6人回复
依托企业入选了国家启明计划青年人才。有无高校可以引进的。
已经有10人回复
天津大学招2026.09的博士生,欢迎大家推荐交流(博导是本人)
已经有9人回复
有院领导为了换新车,用横向课题经费买了俩车
已经有10人回复
遇见不省心的家人很难过
已经有24人回复
AI 太可怕了,写基金时,提出想法,直接生成的文字比自己想得深远,还有科学性
已经有6人回复
酰胺脱乙酰基
已经有13人回复
有时候真觉得大城市人没有县城人甚至个体户幸福
已经有10人回复
» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:
怎么在Origin里插入Angstrom Å这个符号,实在弄不出来啊,求帮忙!
已经有3人回复
我们课题组招聘,MD 模拟方面——最好精于NAMD gromacs 做生物分子模拟
已经有55人回复
在gromacs中运行mdrun命令时出错
已经有10人回复
gromacs做全原子模拟时候,突然到MD这一步出错
已经有6人回复

声梦奇缘001
木虫 (正式写手)
- 应助: 56 (初中生)
- 金币: 5597.4
- 红花: 5
- 帖子: 614
- 在线: 218.7小时
- 虫号: 2406187
- 注册: 2013-04-07
- 专业: 化学工程及工业化学

2楼2014-10-23 16:11:31

3楼2014-10-23 17:11:41













回复此楼