| 查看: 731 | 回复: 2 | ||
[求助]
gromacs新手，md之后，为什么提不出来结构呢？ 已有1人参与
|
|
我使用Gromacs跑的md，想取出一些能量较低点的结构 使用的命令是： trjconv -f XX.xtc -s XX.tpr -b X -e X -o X.gro 然后选择group（1）， 显示如下： Will write gro: Coordinate file in Gromos-87 format Reading file md.tpr, VERSION 4.6.5 (double precision) Reading file md.tpr, VERSION 4.6.5 (double precision) Select group for output Group 0 ( System) has 29 elements Group 1 ( Other) has 29 elements Group 2 ( H2SO4) has 7 elements Group 3 ( h2o) has 9 elements Group 4 ( tma) has 13 elements Select a group: 1 Selected 1: 'Other' Last frame -1 time 0.000 Precision of traj.xtc is 0.001 (nm) Using output precision of 0.001 (nm) WARNING no output, last frame read at t=95.8 gcq#76: "It Costs Too Much If It Costs a Lot" (Magnapop) 这是什么问题呢？？求高手帮助！ |
回复此楼» 猜你喜欢
现代”学阀”该如何界定
已经有12人回复
-
国社科系统bug了，是不是要放榜了？
已经有10人回复
-
课题组招2027级博士 上海工程技术大学 激光智能制造方向
已经有4人回复
-
上海工程技术大学 激光智能制造课题组 2027级博士研究生招生
已经有3人回复
-
上海工程技术大学激光智能制造课题组｜2027级博士研究生招生公告
已经有11人回复
-
我的奶奶
已经有3人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 怎么在Origin里插入Angstrom Å这个符号，实在弄不出来啊，求帮忙！
已经有3人回复
- 我们课题组招聘，MD 模拟方面——最好精于NAMD gromacs 做生物分子模拟
已经有55人回复
- 在gromacs中运行mdrun命令时出错
已经有10人回复
- gromacs做全原子模拟时候，突然到MD这一步出错
已经有6人回复
声梦奇缘001
木虫 (正式写手)
- 应助: 56 (初中生)
- 金币: 5597.4
- 红花: 5
- 帖子: 614
- 在线: 218.7小时
- 虫号: 2406187
- 注册: 2013-04-07
- 专业: 化学工程及工业化学
2楼2014-10-23 16:11:31
3楼2014-10-23 17:11:41