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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 【讨论】关于蛋白质pdb文件修复的问题！[已解决]
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zhlrui

银虫 (小有名气)

[交流] 【讨论】关于蛋白质pdb文件修复的问题！[已解决]

各位xdjm，我研究的是比较大的跨膜蛋白，打算用gromacs研究与药物的相互作用，蛋白有1200多个残基，但是pdb文件存在一些错误，大家知道如何检测以及如何修复吗？用什么程序啊？先谢过了！！！
现在是知道可以用这个pbd文件做了
[search]gromacs[/search]

[ Last edited by zhlrui on 2008-5-15 at 16:13 ]
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为了理想而奋斗
1楼 2008-05-05 09:27:35
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zhlrui

银虫 (小有名气)
好像可以了，不用怎么处理
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为了理想而奋斗
3楼2008-05-14 16:53:48
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zhlrui

银虫 (小有名气)
另外蛋白是一个四聚体，有四段相同的链组成，是不是需要把链联在一起啊？gromacs可以做四段的大蛋白吗？药物分子倒是挺小的
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为了理想而奋斗
2楼2008-05-05 21:46:51
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bioinflab

银虫 (小有名气)
★
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢
引用回帖:
Originally posted by zhlrui at 2008-5-5 21:46:
另外蛋白是一个四聚体，有四段相同的链组成，是不是需要把链联在一起啊？gromacs可以做四段的大蛋白吗？药物分子倒是挺小的

四聚体肯定不能把链联在一起
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4楼2008-05-14 19:47:24
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