24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 435  |  回复: 3
当前主题已经存档。

zhlrui

银虫 (小有名气)

[交流] 【讨论】关于蛋白质pdb文件修复的问题![已解决]

各位xdjm,我研究的是比较大的跨膜蛋白,打算用gromacs研究与药物的相互作用,蛋白有1200多个残基,但是pdb文件存在一些错误,大家知道如何检测以及如何修复吗?用什么程序啊?先谢过了!!!
现在是知道可以用这个pbd文件做了
[search]gromacs[/search]

[ Last edited by zhlrui on 2008-5-15 at 16:13 ]
回复此楼
为了理想而奋斗
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhlrui

银虫 (小有名气)

另外蛋白是一个四聚体,有四段相同的链组成,是不是需要把链联在一起啊?gromacs可以做四段的大蛋白吗?药物分子倒是挺小的
为了理想而奋斗
2楼2008-05-05 21:46:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhlrui

银虫 (小有名气)

好像可以了,不用怎么处理
为了理想而奋斗
3楼2008-05-14 16:53:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bioinflab

银虫 (小有名气)


lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢
引用回帖:
Originally posted by zhlrui at 2008-5-5 21:46:
另外蛋白是一个四聚体,有四段相同的链组成,是不是需要把链联在一起啊?gromacs可以做四段的大蛋白吗?药物分子倒是挺小的

四聚体肯定不能把链联在一起
4楼2008-05-14 19:47:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zhlrui 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 085600,321分求调剂 +15 大馋小子 2026-04-04 16/800 2026-04-08 22:59 by jean5056
[考研] 求调剂 +13 柒luck 2026-04-07 13/650 2026-04-08 22:46 by 猪会飞
[考研] 机械专硕273请求调剂 +6 庚申壬申 2026-04-07 6/300 2026-04-08 22:41 by bljnqdcc
[考研] 070300化学 求调剂 +8 73372112 2026-04-08 8/400 2026-04-08 22:21 by 猪会飞
[考研] 085404,334分,求调剂 +5 sunjie8888 2026-04-08 5/250 2026-04-08 21:39 by 313165yang
[考研] 材料考研求调剂总分280 +30 mkjlz1 2026-04-06 35/1750 2026-04-08 21:25 by cyh—315
[考研] 324求调剂 +17 想上学求调 2026-04-03 17/850 2026-04-08 20:04 by 我减肥1
[考研] 328求调剂 +16 lftmya 2026-04-07 17/850 2026-04-08 18:45 by 环化材-小生
[考研] 0703化学调剂325分 +13 15771691647 2026-04-04 14/700 2026-04-08 10:28 by screening
[考研] 388求调剂 +6 四川王涛 2026-04-07 8/400 2026-04-08 00:17 by JourneyLucky
[考研] 305分求调剂 +3 哈_哈_哈_哈_哈 2026-04-04 5/250 2026-04-07 14:49 by 哈_哈_哈_哈_哈
[考研] 一志愿武理车辆专硕总分 281 求调剂 +4 上岸研究生. 2026-04-02 4/200 2026-04-07 09:52 by 加油向未来啊
[考研] 334分控制工程求调剂 +4 姜尚真sadasd 2026-04-03 4/200 2026-04-07 09:26 by 蓝云思雨
[考研] 材料专硕322 +11 哈哈哈吼吼吼哈 2026-04-05 11/550 2026-04-06 14:07 by lqwchd
[考研] 0855求调剂材料 +11 红桃灼灼 2026-04-04 12/600 2026-04-06 10:26 by 蓝云思雨
[考研] 327求调剂 +4 拾光任染 2026-04-05 4/200 2026-04-05 20:16 by 南航~万老师
[考研] 材料383求调剂 +5 郭阳阳阳成 2026-04-04 5/250 2026-04-04 19:06 by dongzh2009
[考研] 085701求调剂 +7 龚禹铭 2026-04-04 8/400 2026-04-04 13:49 by 小小树2024
[考研] 283分材料与化工求调剂 +29 罗KAKA 2026-04-02 29/1450 2026-04-03 23:56 by userper
[考研] 兽医调剂 +3 wh119216 2026-04-02 3/150 2026-04-03 19:34 by zrongyan
信息提示
请填处理意见