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xiemeng101新虫 (小有名气)
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multiwfn生成了一个cube文件，用高斯view和chem3D打开这个cube文件，图片显示的不一样 已有1人参与
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我是准备做个空间的电子密度差图，先用multiwfn生成了一个cube文件，分别用高斯view和chem3D打开这个cube文件，为什么图片显示的不一样呢？（1是高斯view打开的结果，2是chem3D显示的结果） 另外，我还想问下，在用multiwfn生成cube文件的时候，the value of isosurface 代表什么物理意义？是随便设置的吗？有没有什么选择要求？  1.png  2.png |
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zhou2009
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2楼2014-10-23 10:51:57
xiemeng101
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哦，我明白了，是我两个软件在显示电子密度差图时自动选取的the value of the isosurface 不一致导致的，而我也没有进行进一步的设置。 我看multiwfn的手册上有个例子，选取的the value of the isosurface为0.001，表示空间内电子密度为0.001的等值面，即分子范德华表面。the value of the isosurface的值不一定要选取0.001，只要将各部位的电子密度变化的形势表示清楚就可以了，是不，周老师？ 我还有个问题，一般选取the value of the isosurface =0.001的分子范德华表面，是有某些特性会在这个范德华表面显示出来吗？还是其他的原因？ |
3楼2014-10-23 16:22:43