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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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fish637

铜虫 (初入文坛)

[求助] gromacs能否设定温降速率? 已有1人参与

想模拟体系随温降分子聚集的情况,不知能否设置gromacs按照一定温降速率进行模拟,求各位大神们指点~
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wbn

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
abinitio: 金币+1, 鼓励交流 2014-12-05 07:41:14
fish637: 金币+5 2015-01-14 08:45:16
能。 查 Simulated annealing. 给你个mdp 实例:
Tcoupl              =  Nose-Hoover
tc-grps             =  XXX
tau_t               =  0.2
ref_t               =  300.0
annealing           =  single
annealing-npoints   =  4
annealing-time      =  0 1000 2000 3000
annealing-temp      =  500 500 300 300
2楼2014-12-05 03:56:06
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