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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体软件 » 求高手指导这种情况，解出的无序氧原子形成的氢键如何画图？
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天道酬勤sure

木虫 (小有名气)

[求助] 求高手指导这种情况，解出的无序氧原子形成的氢键如何画图？ 已有1人参与

如题，得到一个结构，在mercury里面一个甲醇中无序的两个氧原子连接在一起如图所示，占有率低的氧原子O5‘与另外一个甲醇氧原子O7形成2A左右的氢键，而占有率高的O5与O7的距离是4A左右。这种情况怎么用diamond画图？

求高手指导这种情况，解出的无序氧原子形成的氢键如何画图？
mercury.JPG


求高手指导这种情况，解出的无序氧原子形成的氢键如何画图？-1
diamond.JPG
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1楼 2014-10-08 11:00:49
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jackdeng

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
在diamond中将无序的部分屏蔽掉（通过filter功能就能实现），用占有率较大的部分做氢键图就行了。
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2楼2014-10-08 16:22:47
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天道酬勤sure

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by jackdeng at 2014-10-08 16:22:47
在diamond中将无序的部分屏蔽掉（通过filter功能就能实现），用占有率较大的部分做氢键图就行了。

那样的话距离会很长，形成的氢键有4A左右，这样可以么？
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3楼2014-10-08 17:50:36
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jackdeng

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

4埃不能算作是氢键，那你就留下氢键合理的那部分，因为原子的无序会造成氢键的变化，所以，讨论氢键没有太大的实际意义。
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4楼2014-10-09 09:03:33
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