应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Abinit » Abinit网站中最新的PAW赝势库如何处理
131/2返回列表12下一页
查看: 3206  |  回复: 12
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

lidx123

木虫 (小有名气)

[求助] Abinit网站中最新的PAW赝势库如何处理 已有1人参与

请问Abinit网站中最新的PAW赝势库，下载下来的赝势的格式为.xml，怎么将其转化为可用于计算的格式？

Abinit网站中最新的PAW赝势库如何处理
C{RK%2U0@V79P]}FPTY$6]7.png
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2014-10-07 17:26:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

KalaShayminS

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
lidx123: 金币+3, ★★★很有帮助, 谢谢，试一下 2014-10-08 13:27:55
旧版的ABINIT不支持，得用AtomPAW提供的，新版直接用就行。
赞一下 回复此楼
2楼2014-10-07 19:45:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lidx123

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by KalaShayminS at 2014-10-07 19:45:52
旧版的ABINIT不支持，得用AtomPAW提供的，新版直接用就行。

但是我试着装了最新版的7.8.2
结果计算时出现：
administrator@ubuntu:~/lidx/js123$ abinit < tpaw.files > tmp-log

--- !ERROR
message: |
    Cannot use LibXC functional because ABINIT is not compiled with LibXC !
src_file: m_pawpsp.F90
src_line: 4712
...
这是怎么回事？
赞一下 回复此楼
3楼2014-10-08 22:03:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

KalaShayminS

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by lidx123 at 2014-10-08 22:03:53
但是我试着装了最新版的7.8.2
结果计算时出现：
administrator@ubuntu:~/lidx/js123$ abinit < tpaw.files > tmp-log

--- !ERROR
message: |
    Cannot use LibXC functional because ABINIT is not ...

编译ABINIT的时候要包括libxc。
赞一下 回复此楼
4楼2014-10-08 22:25:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lidx123

木虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by KalaShayminS at 2014-10-08 22:25:35
编译ABINIT的时候要包括libxc。...

具体如何编译，能否给出具体命令？
或者如何安装libxc？
赞一下 回复此楼
5楼2014-10-08 23:01:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

KalaShayminS

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by lidx123 at 2014-10-08 23:01:43
具体如何编译，能否给出具体命令？
或者如何安装libxc？...

参见程序自己的说明，configure的时候加上选项
--with-dft-flavor=libxc
赞一下 回复此楼
6楼2014-10-08 23:16:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lidx123

木虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by KalaShayminS at 2014-10-08 23:16:02
参见程序自己的说明，configure的时候加上选项
--with-dft-flavor=libxc...

已经下载了libxc
# ./configure --with-dft-flavor=libxc
#make
#make install
但是在# ./configure --with-dft-flavor=libxc时，出现configure: WARNING: unrecognized options: --with-dft-flavor
接下来的make,出现：
make[2]: Leaving directory `/home/administrator/lidx/libxc-2.0.1/testsuite'
make[2]: Entering directory `/home/administrator/lidx/libxc-2.0.1'
make[2]: Leaving directory `/home/administrator/lidx/libxc-2.0.1'
make[1]: Leaving directory `/home/administrator/lidx/libxc-2.0.1'
接着make install时，出现错误
administrator@ubuntu:~/lidx/libxc-2.0.1$ sudo make install
[sudo] password for administrator:
Making install in build
make[1]: Entering directory `/home/administrator/lidx/libxc-2.0.1/build'
make[2]: Entering directory `/home/administrator/lidx/libxc-2.0.1/build'
make[2]: Nothing to be done for `install-exec-am'.
/bin/mkdir -p '/opt/etsf/lib/pkgconfig'
/usr/bin/install -c -m 644 libxc.pc '/opt/etsf/lib/pkgconfig'
make[2]: Leaving directory `/home/administrator/lidx/libxc-2.0.1/build'
make[1]: Leaving directory `/home/administrator/lidx/libxc-2.0.1/build'
Making install in src
make[1]: Entering directory `/home/administrator/lidx/libxc-2.0.1/src'
make  install-am
make[2]: Entering directory `/home/administrator/lidx/libxc-2.0.1/src'
make[3]: Entering directory `/home/administrator/lidx/libxc-2.0.1/src'
/bin/mkdir -p '/opt/etsf/lib'
/bin/bash ../libtool   --mode=install /usr/bin/install -c   libxc.la '/opt/etsf/lib'
libtool: install: /usr/bin/install -c .libs/libxc.lai /opt/etsf/lib/libxc.la
libtool: install: /usr/bin/install -c .libs/libxc.a /opt/etsf/lib/libxc.a
libtool: install: chmod 644 /opt/etsf/lib/libxc.a
libtool: install: ranlib /opt/etsf/lib/libxc.a
libtool: finish: PATH="/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/sbin:/bin:/sbin" ldconfig -n /opt/etsf/lib
----------------------------------------------------------------------
Libraries have been installed in:
   /opt/etsf/lib

If you ever happen to want to link against installed libraries
in a given directory, LIBDIR, you must either use libtool, and
specify the full pathname of the library, or use the `-LLIBDIR'
flag during linking and do at least one of the following:
   - add LIBDIR to the `LD_LIBRARY_PATH' environment variable
     during execution
   - add LIBDIR to the `LD_RUN_PATH' environment variable
     during linking
   - use the `-Wl,-rpath -Wl,LIBDIR' linker flag
   - have your system administrator add LIBDIR to `/etc/ld.so.conf'

See any operating system documentation about shared libraries for
more information, such as the ld(1) and ld.so(8) manual pages.
----------------------------------------------------------------------
/bin/mkdir -p '/opt/etsf/include'
/usr/bin/install -c -m 644 xc.h xc_config.h '/opt/etsf/include'
/bin/mkdir -p '/opt/etsf/include'
/usr/bin/install -c -m 644 xc_funcs.h libxc_funcs_m.mod xc_f90_lib_m.mod xc_f90_types_m.mod '/opt/etsf/include'
make[3]: Leaving directory `/home/administrator/lidx/libxc-2.0.1/src'
make[2]: Leaving directory `/home/administrator/lidx/libxc-2.0.1/src'
make[1]: Leaving directory `/home/administrator/lidx/libxc-2.0.1/src'
Making install in testsuite
make[1]: Entering directory `/home/administrator/lidx/libxc-2.0.1/testsuite'
make[2]: Entering directory `/home/administrator/lidx/libxc-2.0.1/testsuite'
make[2]: Nothing to be done for `install-exec-am'.
make[2]: Nothing to be done for `install-data-am'.
make[2]: Leaving directory `/home/administrator/lidx/libxc-2.0.1/testsuite'
make[1]: Leaving directory `/home/administrator/lidx/libxc-2.0.1/testsuite'
make[1]: Entering directory `/home/administrator/lidx/libxc-2.0.1'
make[2]: Entering directory `/home/administrator/lidx/libxc-2.0.1'
make[2]: Nothing to be done for `install-exec-am'.
/bin/mkdir -p '/opt/etsf/include'
/usr/bin/install -c -m 644 xc_version.h '/opt/etsf/include'
make[2]: Leaving directory `/home/administrator/lidx/libxc-2.0.1'
make[1]: Leaving directory `/home/administrator/lidx/libxc-2.0.1'
administrator@ubuntu:~/lidx/libxc-2.0.1$
赞一下 回复此楼
7楼2014-10-08 23:43:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

KalaShayminS

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
lidx123: 金币+3, ★★★很有帮助 2014-10-09 17:26:53
libxc不是单独装的，是在abinit的configure的时候加上的选项。
赞一下 回复此楼
8楼2014-10-09 00:22:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lidx123

木虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by KalaShayminS at 2014-10-09 00:22:13
libxc不是单独装的，是在abinit的configure的时候加上的选项。

请问在abinit的configure的时候
命令为：./configure --with-dft-flavor=libxc
但是make时，出现一下错误：
make[3]: Leaving directory `/home/administrator/lidx/abinit-7.8.2/tests'
make[2]: Leaving directory `/home/administrator/lidx/abinit-7.8.2/tests'
make[2]: Entering directory `/home/administrator/lidx/abinit-7.8.2'
make[2]: Leaving directory `/home/administrator/lidx/abinit-7.8.2'
make[1]: Leaving directory `/home/administrator/lidx/abinit-7.8.2

sudo make install时，出现：
nit-test/doc/help_make'
make[3]: Leaving directory `/home/administrator/lidx/abinit-7.8.2/tests'
make[2]: Leaving directory `/home/administrator/lidx/abinit-7.8.2/tests'
make[1]: Leaving directory `/home/administrator/lidx/abinit-7.8.2/tests'
make[1]: Entering directory `/home/administrator/lidx/abinit-7.8.2'
make[2]: Entering directory `/home/administrator/lidx/abinit-7.8.2'
make[2]: Nothing to be done for `install-exec-am'.
/usr/bin/install -c -d -m 755 /usr/local/lib/pkgconfig
/usr/bin/install -c -m 644 -m 644 config.pc \
         /usr/local/lib/pkgconfig/abinit.pc
make[2]: Leaving directory `/home/administrator/lidx/abinit-7.8.2'
make[1]: Leaving directory `/home/administrator/lidx/abinit-7.8.2'

请问这怎么解决，是不是需要把“libxc”文件放在什么地方，再进行configure？
赞一下 回复此楼
9楼2014-10-09 17:35:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

KalaShayminS

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
lidx123: 金币+4, ★★★很有帮助, 还有就是，利用2013.9月产生的XML赝势就不会出现此错误信息了。 2014-10-13 16:12:02
引用回帖:
9楼: Originally posted by lidx123 at 2014-10-09 17:35:04
请问在abinit的configure的时候
命令为：./configure --with-dft-flavor=libxc
但是make时，出现一下错误：
make: Leaving directory `/home/administrator/lidx/abinit-7.8.2/tests'
make: Leaving director ...

这不是错误，是正常结束信息。
赞一下 回复此楼
10楼2014-10-10 19:25:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 lidx123 的主题更新
131/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 今天系统多次维护，明天很可能放榜！ +5 zju2000 2026-08-16 5/250 2026-08-16 23:23 by Haru815
[基金申请] 2027广东省杰青 +3 奶牛小黑 2026-08-15 6/300 2026-08-16 20:07 by 奶牛小黑
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜？ +9 Ldrop2023 2026-08-13 9/450 2026-08-16 13:24 by wukun_007
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 26/1300 2026-08-16 12:35 by 启萌科技
[基金申请] 我的国基提前知道中了，可是同事的操作让我实在接受不了，怎么会有这样的人 +11 家与远方 2026-08-10 16/800 2026-08-16 10:28 by ray43
[基金申请] 有时候，自然基金真的不能太认真 （我的申报经验） +10 majunge000 2026-08-11 12/600 2026-08-16 08:18 by xli1984
[精细化工] 招聘 金属平磨液，抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +6 wangze12014 2026-08-14 7/350 2026-08-15 20:12 by gltch
[基金申请] filecode +8 cratir 2026-08-14 12/600 2026-08-15 18:08 by zyfgau
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +10 majunge000 2026-08-10 13/650 2026-08-15 12:26 by hanpeng972
[基金申请] 各位道友，我要去昆明玩几天，回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[基金申请] 奇怪，两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +8 布布和一二 2026-08-10 11/550 2026-08-14 14:58 by Equinoxhua
[基金申请] filecode +15 documentary 2026-08-10 17/850 2026-08-14 10:08 by kissu88
[基金申请] 静等基金结果 +8 gjjjzhong 2026-08-10 21/1050 2026-08-13 17:56 by 且听虎啸
[基金申请] 重要来源：本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +4 布布和一二 2026-08-11 5/250 2026-08-13 12:56 by cratir
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见，大家看看几个A，几个B? +11 Tide man 2026-08-11 11/550 2026-08-13 07:35 by 撸猫猫
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭