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yjcmwgk禁虫 (文坛精英)
密度泛函·小卒
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[求助]
用Python读Gaussian的cube文件，速度很慢，怎么破？谢谢！！！ 已有4人参与
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向各位python大侠求教一个问题，谢谢各位！ 我正在用python读一个由Gaussian生成的cube文件。但是读文件读得非常慢，读一个6M多的cube文件，居然用了3分钟！ 具体问题如下： 用cubefile来打开某个cube文件。然后继续 我怀疑tmpline = tmplines[i-1]这句话拖累的速度？应该如何修改？非常感谢高手帮助！！ 感谢！！ |
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rh1127
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8楼2014-10-05 14:47:46
yjcmwgk
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2楼2014-10-04 11:08:58
【答案】应助回帖
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yjcmwgk: 金币+20, ★有帮助, 非常感谢，我后来用tmpp = ((' '.join(cubefile.readlines())).replace("/n"," ")).split()解决了 2014-10-05 16:10:10
gmy1990: 金币+3 2014-10-05 18:49:03
感谢参与，应助指数 +1
yjcmwgk: 金币+20, ★有帮助, 非常感谢，我后来用tmpp = ((' '.join(cubefile.readlines())).replace("/n"," ")).split()解决了 2014-10-05 16:10:10
gmy1990: 金币+3 2014-10-05 18:49:03
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试试这个，看看效果如何： [ code] tmplines = cubefile.readlines() tempstr = "".join(tmplines) #把list转化为str，形式应该是'num num ...num\nnum ...' tempstr = tempstr.replace('\n',' ') #把str中的'\n'替换为' ' tmpcubedata = tempstr.split(' ') #把str转为list n=0 numcount=len(tmpcubedata) #list的数据总数 for i in tmpcubedata: n+=1 if i%60000==0: print "Converting", cubefilename, "...... ", int(100.0*float(i)/float(numcount)), "%" #if i=="": #tmpcubedata.remove(i) #如果cubefile 文件中中间有空行，则需要这个功能 if tmpcubedata[-1]=="": del tmpcubedata[-1] #如果cubefile 文件以‘num\n‘结尾 print "Converting", cubefilename, "...... ", "100 %" [ /code] |
3楼2014-10-04 15:23:36
rh1127
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【答案】应助回帖
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yjcmwgk: 金币+20, ★有帮助, 非常感谢，我后来用tmpp = ((' '.join(cubefile.readlines())).replace("/n"," ")).split()解决了 2014-10-05 16:10:21
gmy1990: 金币+2 2014-10-05 18:49:14
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yjcmwgk: 金币+20, ★有帮助, 非常感谢，我后来用tmpp = ((' '.join(cubefile.readlines())).replace("/n"," ")).split()解决了 2014-10-05 16:10:21
gmy1990: 金币+2 2014-10-05 18:49:14
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用numpy和pandas模块儿来处理大型数组，比只用for循环速度快几十倍不止。python自带的循环未经优化，很忌讳来处理大型数组！ 希望对你有帮助。 |
4楼2014-10-05 09:21:10
28
