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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 筛出一株相似度为90％的菌是不是新种
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cx13033236

木虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
只测16S的话只能鉴定到属
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11楼2014-09-30 15:54:00
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圣迭戈

铜虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
8楼: Originally posted by 2012013923 at 2014-09-29 22:30:09
您好，请教一下这个新属和新种相似度有什么界定吗，比如百分之多少就是新属，我只看过书上说85%，不知道对不对。请不吝赐教...

同意楼上的说法，一般99%，最多97%以下就可以算不是同种了。你这个可以放心。
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12楼2014-10-02 00:25:43
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luobin506

禁虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
本帖内容被屏蔽
13楼2014-10-14 10:28:03
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luobin506

禁虫 (著名写手)
本帖内容被屏蔽
14楼2014-10-14 10:28:49
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liuhaolin3

至尊木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
你要去韩国网站比对，才能确定

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15楼2014-10-14 13:05:26
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greathorn

铜虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
yes, I think so. 90% is enough.
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16楼2014-10-14 14:19:47
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lgd19891003

铁虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
细菌分类中，相似性97%为种的界限，95%为属的界限，但是98%也可能是新种，基因比对晚不是全部，应该还需要进行其他项的鉴定，你的90%，我怀疑是不是你的比对有问题，相似性太低了，如果你克隆完比对是这样，那你很可能发现了分类级别很高的菌了。
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不懂就不懂，不能欺人，也不自欺
17楼2014-10-16 19:18:01
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lylbiodiesel

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
17楼: Originally posted by lgd19891003 at 2014-10-16 19:18:01
细菌分类中，相似性97%为种的界限，95%为属的界限，但是98%也可能是新种，基因比对晚不是全部，应该还需要进行其他项的鉴定，你的90%，我怀疑是不是你的比对有问题，相似性太低了，如果你克隆完比对是这样，那你很可 ...

是连接到质粒克隆测过的，在ncbi比对的，但是老师不让做它的研究，就放在那，让我做别的。

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山东
18楼2014-10-16 19:32:33
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gowe_001

银虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
请问筛出新种属可以干什么用呢？

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19楼2014-10-16 22:05:52
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拂晓晨风

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
其实随便筛选个菌菌，你去测测序列，基本上都找不出100%同源的，要发文章，如果仅仅只是做了一些简单的使用，想凭借说发现同源90%的新种想发好文章很难。
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20楼2014-10-22 21:58:22
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