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lylbiodiesel

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
20楼: Originally posted by 拂晓晨风 at 2014-10-22 21:58:22
其实随便筛选个菌菌,你去测测序列,基本上都找不出100%同源的,要发文章,如果仅仅只是做了一些简单的使用,想凭借说发现同源90%的新种想发好文章很难。

哦   明白了,还需要做一些其他的什么实验

[ 发自小木虫客户端 ]
山东
21楼2014-10-23 09:53:09
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拂晓晨风

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
21楼: Originally posted by lylbiodiesel at 2014-10-23 09:53:09
哦   明白了,还需要做一些其他的什么实验
...

你想投文章,你就去数据库里下载类似的文献看看啊
22楼2014-10-23 16:29:18
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20093651

铁杆木虫 (职业作家)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
估计不靠谱,你把序列发给我,我来给你比对比对
但行好事,莫问前程
23楼2014-10-23 21:15:52
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dllchina

木虫 (著名写手)

有机的微生物大神


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你的序列长度~分离来源呢?~90%是挺低的,你可以把最相似类群告诉我们~90%也不一定
24楼2014-10-23 23:54:01
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wubingqi

木虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
90%很可能是新属了,一般97%以下就可以考虑是新种了,当然首先要保证序列测定准确,其次还有做各种生理生化实验、DNA杂交等才能最终确认。不知道你是从什么环境中采用什么手段分离到的菌株,现在发现一个新种都很难的,如果真的发现了新属,恭喜楼主。建议你截图发上来让大家看看。
25楼2014-10-24 09:16:29
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lylbiodiesel

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
25楼: Originally posted by wubingqi at 2014-10-24 09:16:29
90%很可能是新属了,一般97%以下就可以考虑是新种了,当然首先要保证序列测定准确,其次还有做各种生理生化实验、DNA杂交等才能最终确认。不知道你是从什么环境中采用什么手段分离到的菌株,现在发现一个新种都很难 ...

这是比对结果
筛出一株相似度为90%的菌是不是新种
T5P_(ODMTGYC`Q%`Z5BITRK.jpg

山东
26楼2014-10-24 14:07:13
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lylbiodiesel

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
23楼: Originally posted by 20093651 at 2014-10-23 21:15:52
估计不靠谱,你把序列发给我,我来给你比对比对

这是比对结果
筛出一株相似度为90%的菌是不是新种-1
T5P_(ODMTGYC`Q%`Z5BITRK.jpg

山东
27楼2014-10-24 14:07:58
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不止止止止

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by lylbiodiesel at 2014-09-29 09:16:56
细菌,27f,1496r,PCR产物测过,连接到质粒克隆测过,我也不懂,我是环境工程专业,在NCBI上点blast后有点的microbe
...

请问你是怎么连到质粒上的呀,根据16S rDNA的测序结果直接设计引物吗
28楼2021-07-28 15:23:51
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