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哇哇乱叫

铜虫 (小有名气)

[求助] 自学primer 5.0的一些疑惑,有大神可以来解答下吗? 已有1人参与

自己是本科,觉得还是学点东西得好,而且做实验有时候看别人会自己不会也会很尴尬,感觉被排除在外了。最近在自学引物设计,用的是primer 5.0,现在只是对这个软件有了了解,各个按键,窗口的功能已经了解,但是具体怎样才算是设计出一个引物,因为现在没有试验,不知道怎么去练习。而且最近明白引物设计应该还是有好有坏,差别很大,但是具体怎么是好怎么是坏自己也不是太明白。还有,我们的实验有些会自己设计探针,我想问下,primer 5.0可以设计探针吗,我用的win 7,所以不能装Primer Express。
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时间会证明一切
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kissmet

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

设计引物探针的 直接用这个网站吧 比primer premier 5简单 而且方便不少
http://www.idtdna.com/PrimerQues ... play=AdvancedParams
7楼2017-12-08 16:12:13
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Merrylegs

金虫 (正式写手)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-09-25 21:36:28
个人观点:软件设计所得的引物只是从生物信息学角度给出最佳的选择,引物的效果最终还是要通过实际进行PCR才能得到验证。有时候在软件设计时感觉非常完美的引物,实际操作可能效果并不好;而有些在软件中感觉缺陷很大的引物实际PCR效果却非常完美。
ps:设计探针的功能还没用过
2楼2014-09-25 14:54:01
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oaixlittle

金虫 (初入文坛)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-09-25 21:36:31
可以,点search,顶上三个选项:PCR引物,测序引物,杂交探针
下面设置好引物长度,上下游引物位置和片段长度,点OK就行,出来的结果挑分数高的
3楼2014-09-25 16:51:23
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Merrylegs

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by oaixlittle at 2014-09-25 16:51:23
可以,点search,顶上三个选项:PCR引物,测序引物,杂交探针
下面设置好引物长度,上下游引物位置和片段长度,点OK就行,出来的结果挑分数高的

谢谢,学习了
4楼2014-09-26 15:03:57
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