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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 自学primer 5.0的一些疑惑，有大神可以来解答下吗？
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哇哇乱叫

铜虫 (小有名气)

[求助] 自学primer 5.0的一些疑惑，有大神可以来解答下吗？ 已有1人参与

自己是本科，觉得还是学点东西得好，而且做实验有时候看别人会自己不会也会很尴尬，感觉被排除在外了。最近在自学引物设计，用的是primer 5.0，现在只是对这个软件有了了解，各个按键，窗口的功能已经了解，但是具体怎样才算是设计出一个引物，因为现在没有试验，不知道怎么去练习。而且最近明白引物设计应该还是有好有坏，差别很大，但是具体怎么是好怎么是坏自己也不是太明白。还有，我们的实验有些会自己设计探针，我想问下，primer 5.0可以设计探针吗，我用的win 7，所以不能装Primer Express。
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时间会证明一切
1楼 2014-09-25 14:22:31
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oaixlittle

金虫 (初入文坛)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-09-25 21:36:31
可以，点search，顶上三个选项：PCR引物，测序引物，杂交探针
下面设置好引物长度，上下游引物位置和片段长度，点OK就行，出来的结果挑分数高的
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3楼2014-09-25 16:51:23
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Merrylegs

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-09-25 21:36:28
个人观点：软件设计所得的引物只是从生物信息学角度给出最佳的选择，引物的效果最终还是要通过实际进行PCR才能得到验证。有时候在软件设计时感觉非常完美的引物，实际操作可能效果并不好；而有些在软件中感觉缺陷很大的引物实际PCR效果却非常完美。
ps：设计探针的功能还没用过
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2楼2014-09-25 14:54:01
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Merrylegs

金虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by oaixlittle at 2014-09-25 16:51:23
可以，点search，顶上三个选项：PCR引物，测序引物，杂交探针
下面设置好引物长度，上下游引物位置和片段长度，点OK就行，出来的结果挑分数高的

谢谢，学习了
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4楼2014-09-26 15:03:57
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444565008qq

新虫 (小有名气)
能把Primer 5软件分享一下吗，我现在也在学引物设计，能不能交流一下。非常感谢
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5楼2014-12-28 13:55:09
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