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Crescendo

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] dsRNA合成策略的一些思考

最近计划合成dsRNA,

方法一,用带T7序列的上下游引物扩增目标基因序列得到dsDNA,以此dsDNA为模板进而合成合成+(-)ssDNA,最后根据试剂盒说明以ssDNA合成dsRNA;
方法二,用不带T7上下游引物扩增目标基因序列得到dsDNA,连接到pGEM-T载体(此载体带T7序列和SP6序列),测序验证正确后,再以此携带目标基因序列的pGEM-T质粒为模板,以T7和SP6引物扩增目标序列得dsDNA,此时理论上该dsDNA带有T7和SP6序列以及一些酶切位点序列;以此dsDNA为模板用T7引物合成+ssDNA,最后根据试剂盒说明以ssDNA合成dsRNA。

第一种方法最为省事,但我目前没有带T7序列的引物,合成后再做,要花一些时间,现在手头上有带目标基因序列的pGEM-T质粒。
求教:
第二种方法可行吗?
会不会因为增加了酶切位点的序列而影响后续RNA干扰效果?
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日拱一卒,功不唐捐
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