| 查看: 1717 | 回复: 1 | |||
好好学习444超级版主
|
[求助]
新手学习 KALP15 in DPPC实例咨询
|
|
做了是实例一没问题，当时很受鼓舞，但在前段时间按教程做Tutorial 2: KALP15 in DPPC时，在进行到将dppc.pdb文件转换为gro文件卡住了，后面我是用editconf命令转换的，的那个是接下来的能量最小化过程时gmx grompp -f minim.mdp -c dppc128.gro -p topol_dppc.top -o em.tpr，报错了， error：Back Off! I just backed up mdout.mdp to ./#mdout.mdp.1# Generated 837 of the 2346 non-bonded parameter combinations ERROR 1 [file dppc.itp, line 112]: No default LJ-14 types ERROR 2 [file dppc.itp, line 113]: No default LJ-14 types ERROR 3 [file dppc.itp, line 114]: No default LJ-14 types ERROR 4 [file dppc.itp, line 115]: No default LJ-14 types ..................................................... ERROR 25 [file dppc.itp, line 136]: No default LJ-14 types ERROR 26 [file dppc.itp, line 137]: No default LJ-14 types ERROR 27 [file dppc.itp, line 138]: No default LJ-14 types ERROR 28 [file dppc.itp, line 139]: No default LJ-14 types ERROR 29 [file dppc.itp, line 140]: No default LJ-14 types Excluding 3 bonded neighbours molecule type 'DPPC' Excluding 2 bonded neighbours molecule type 'SOL' 。不知道怎么解决。求各位前辈指导。祝大家身体健康，学习进步！ |
回复此楼» 本帖附件资源列表
-
欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : membrane.rar
2014-09-24 01:18:00, 545.38 K
» 猜你喜欢
309分085801求调剂
已经有7人回复
-
生物学308分求调剂（一志愿华东师大）
已经有3人回复
-
求调剂：一志愿：南京大学 专业：0705 总分320 ，本科985，四六级已过
已经有3人回复
-
环境工程 085701，267求调剂
已经有14人回复
-
308求调剂
已经有12人回复
-
求调剂：085600材料与化工，考材科基，总分319
已经有21人回复
-
311求调剂
已经有8人回复
-
294分080500材料科学与工程求调剂
已经有13人回复
-
288求调剂 一志愿哈工大 材料与化工
已经有19人回复
-
288资源与环境专硕求调剂，不限专业，有学上就行
已经有23人回复
好好学习444
管理员
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 28.6
- 散金: 775
- 红花: 3
- 帖子: 187
- 在线: 152.9小时
- 虫号: 2610161
- 注册: 2013-08-22
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性I:结构、力学和
2楼2014-10-21 23:56:57
