24小时热门版块排行榜    

查看: 922  |  回复: 8

mingimng605

新虫 (初入文坛)

[求助] 散金币 求助解析 肽 的maldi-tof二级质谱的氨基酸序列 分量是1044 已有3人参与

真心求助大家,我的分离纯化的一个多肽,maldi-tof 得到的二级质谱,想要分析得到其多肽的氨基酸序列,但是我研究了好久也没有解出来,麻烦各位专家帮我分析一下,我将仅有的100金币散给大家,就靠着这个序列毕业呢  ,拜托了   。
回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : o22-msms.pdf
  • 2014-09-21 09:07:47, 126.06 K

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
为什么不用现成的搜索引擎?一定要手工读谱吗?
2楼2014-09-21 09:35:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mingimng605

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by wizardfan at 2014-09-21 09:35:50
为什么不用现成的搜索引擎?一定要手工读谱吗?

嗯?不知道有那种可以直接搜索的啊 因为我是鉴定未知的新肽,不知道在哪种搜索引擎可以解析,麻烦你请赐教 谢谢
3楼2014-09-21 10:42:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

http://en.wikipedia.org/wiki/List_of_mass_spectrometry_software

你主要看1.2 de novo。其实1.1 database search也可以做做
4楼2014-09-22 06:59:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mingimng605

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by wizardfan at 2014-09-22 06:59:41
http://en.wikipedia.org/wiki/List_of_mass_spectrometry_software

你主要看1.2 de novo。其实1.1 database search也可以做做

还想请教您一下我看了一下 这个网站好像只是介绍 了这些软件 它好像不能在线应用是吧  需要 在赵地方下载? 麻烦了  以前没接触过这方面的东西  不太懂
5楼2014-09-22 10:49:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

goldendays

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
光靠二级碎片还不能分析出完整序列,比如其中一个113的差值,可能是L也可能是I。
建议你先做一个氨基酸分析或者N/C端测序,如果需要出具权威报告的,建议你找有CNAS或CMA的机构做。如果只是需要图谱的,校内应该都可以做的吧。
当然知道了氨基酸组成也不够,组成的可能是D/L型氨基酸,你还得确定各氨基酸的构型。这个是难点。有机构能测,但要价太高。
6楼2014-09-22 17:11:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

goldendays

木虫 (小有名气)

天然产物中分离出的多肽你应该先试试搜索引擎
搜不到再解谱吧
7楼2014-09-22 17:12:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mingimng605

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by goldendays at 2014-09-22 17:11:13
光靠二级碎片还不能分析出完整序列,比如其中一个113的差值,可能是L也可能是I。
建议你先做一个氨基酸分析或者N/C端测序,如果需要出具权威报告的,建议你找有CNAS或CMA的机构做。如果只是需要图谱的,校内应该都 ...

好的   谢谢您的建议 我在继续研究一下
8楼2014-09-24 16:00:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ritchiejin

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

你用的flexanalysis就可以解析了啊,annotation里面的A工具可以找的,或者先用biotools的denovo试一试。
9楼2014-11-13 13:53:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 mingimng605 的主题更新
信息提示
请填处理意见