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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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mingimng605

新虫 (初入文坛)

[求助] 散金币 求助解析 肽 的maldi-tof二级质谱的氨基酸序列 分量是1044 已有3人参与

真心求助大家,我的分离纯化的一个多肽,maldi-tof 得到的二级质谱,想要分析得到其多肽的氨基酸序列,但是我研究了好久也没有解出来,麻烦各位专家帮我分析一下,我将仅有的100金币散给大家,就靠着这个序列毕业呢  ,拜托了   。
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  • 2014-09-21 09:07:47, 126.06 K

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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
为什么不用现成的搜索引擎?一定要手工读谱吗?
2楼2014-09-21 09:35:50
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mingimng605

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by wizardfan at 2014-09-21 09:35:50
为什么不用现成的搜索引擎?一定要手工读谱吗?

嗯?不知道有那种可以直接搜索的啊 因为我是鉴定未知的新肽,不知道在哪种搜索引擎可以解析,麻烦你请赐教 谢谢
3楼2014-09-21 10:42:53
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

http://en.wikipedia.org/wiki/List_of_mass_spectrometry_software

你主要看1.2 de novo。其实1.1 database search也可以做做
4楼2014-09-22 06:59:41
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mingimng605

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by wizardfan at 2014-09-22 06:59:41
http://en.wikipedia.org/wiki/List_of_mass_spectrometry_software

你主要看1.2 de novo。其实1.1 database search也可以做做

还想请教您一下我看了一下 这个网站好像只是介绍 了这些软件 它好像不能在线应用是吧  需要 在赵地方下载? 麻烦了  以前没接触过这方面的东西  不太懂
5楼2014-09-22 10:49:40
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goldendays

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
光靠二级碎片还不能分析出完整序列,比如其中一个113的差值,可能是L也可能是I。
建议你先做一个氨基酸分析或者N/C端测序,如果需要出具权威报告的,建议你找有CNAS或CMA的机构做。如果只是需要图谱的,校内应该都可以做的吧。
当然知道了氨基酸组成也不够,组成的可能是D/L型氨基酸,你还得确定各氨基酸的构型。这个是难点。有机构能测,但要价太高。
6楼2014-09-22 17:11:13
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goldendays

木虫 (小有名气)

天然产物中分离出的多肽你应该先试试搜索引擎
搜不到再解谱吧
7楼2014-09-22 17:12:40
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mingimng605

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by goldendays at 2014-09-22 17:11:13
光靠二级碎片还不能分析出完整序列,比如其中一个113的差值,可能是L也可能是I。
建议你先做一个氨基酸分析或者N/C端测序,如果需要出具权威报告的,建议你找有CNAS或CMA的机构做。如果只是需要图谱的,校内应该都 ...

好的   谢谢您的建议 我在继续研究一下
8楼2014-09-24 16:00:53
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ritchiejin

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

你用的flexanalysis就可以解析了啊,annotation里面的A工具可以找的,或者先用biotools的denovo试一试。
9楼2014-11-13 13:53:45
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