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yiren98木虫 (正式写手)
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蛋白组学实验中，蛋白鉴定需要搜库，如何下载NCBI nr-Green plant数据库 已有1人参与
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抱歉，以前在线mascot的时候可以选择NCBInr数据库，现在换了地方做蛋白组，需要下载到本地建库。。我在NCBI网站找了半天，不知道如何下载绿色植物总库？特向大神求教， |
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yiren98
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有搜库软件，如果用ftp下载，我没找到单独的绿色植物总库啊，是不是下载所有的nr库，ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/db/FASTA/，在这个里面下载nr.gz？谢谢 |
3楼2014-10-04 09:55:44
hwd6218554
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【答案】应助回帖
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yiren98: 金币+10, ★★★很有帮助, 感谢，我知道库挺大的。 2014-10-04 09:56:03
yiren98: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 谢谢 2014-10-04 15:19:05
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yiren98: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 谢谢 2014-10-04 15:19:05
| http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxo ... de=1&unlock 这个地方可以下载，但是绿色植物蛋白库很大，你下载过程中可能会中断；也可以通过FTP下载，但如果你没有搜库软件的话也没必要下载的。 |
2楼2014-10-03 20:02:01
hwd6218554
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nr.gz 这个是NCBI蛋白质全库，ftp内确实没有按照物种进行分类。如果你要通过ftip下载绿色植物的库就需要下载全库，如果你的物种不是很特殊的话，不要用NCBI的库，NCBI的库量虽然大但是冗余库，建议你去下载uniprot的数据库，质量很高，http://www.matrixscience.com/help/seq_db_setup_sprot.html。 |
4楼2014-10-04 15:01:12
5楼2015-01-05 10:36:51
