应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Wien2k&FLAPW&ELK » mpiifort+mkl编译ELK运行问题求助
51/1返回列表
查看: 2429  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

[求助] mpiifort+mkl编译ELK运行问题求助 已有1人参与

本人编译ELK，采用的是mpiifort（v11）+mkl（v10.2），编译过程没什么问题。问题在于运行过程，我尝试运行了test-001下面例子，计算得到的能量似乎和程序得到的能量有很大差异，如果不采用mkl而采用内置的lib就没有这个问题，但核心利用效率很低（程序如不考虑mkl_thread会按照k并行，如果采用mkl_thread则可以提升效率）。

另外，vasp采用mkl有时也会出现“正能值”的问题。这两个问题是否同一原因导致？（测试下来SIESTA并没有这样的问题）。

对于这些问题有什么解决方案？产生这些问题的原因是什么？从这个问题看，如果是自己写程序该注意些什么？
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

软件交流

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
不一定挂在论坛，计算问题问题欢迎留言。
1楼 2014-09-12 00:42:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

锐利的碎片

木虫 (正式写手)

star watcher
mkl编译要用zfftifc…mkl.f90

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
赞一下 回复此楼
5楼2014-09-12 16:28:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

KalaShayminS

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
卡开发发: 金币+30, ★★★★★最佳答案, ELK下zfftifc_fftw.f90和mkl的选项两者似乎不能同时使用，MKL10有时候确实很不稳定。 2014-09-12 13:58:32
不同版本的MKL的参数会发生一定变化，程序并未修改，这导致有的时候有隐蔽的错误发生——或者对于某些体系有错误发生（内存用量达到一定程度的时候）。
如果算出来和样例不对就肯定有问题，可以尝试换默认LAPACK/BLAS, ATLAS, GotoBLAS等等看看结果有无变化。
赞一下 回复此楼
2楼2014-09-12 03:01:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
★ ★ ★ ★ ★
fzx2008: 金币+5, 谢谢补充 2014-09-12 14:40:02
问题已经解决， zfftifc_fftw.f90用mkl编译会出问题，不采用mkl即可。

非k点并行fft_lib用-lfftw3和-lfftw3_threads即可，编译前做如下设置（参照官网以12核心为例）：
export OMP_NUM_THREADS=4
export OMP_NESTED=true
export OMP_DYNAMIC=false
export MKL_NUM_THREADS=8
export MKL_DYNAMIC=true
这样即便gamma点也可以并行。
赞一下 回复此楼
不一定挂在论坛，计算问题问题欢迎留言。
3楼2014-09-12 13:55:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
忘说了，计算节点运行的时候也要设置环境
export OMP_NUM_THREADS=4
export OMP_NESTED=true
export OMP_DYNAMIC=false
export MKL_NUM_THREADS=8
export MKL_DYNAMIC=true
赞一下 回复此楼
不一定挂在论坛，计算问题问题欢迎留言。
4楼2014-09-12 13:57:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +19 Lanmanbaby 2026-08-09 32/1600 2026-08-12 09:56 by gltch
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见，大家看看几个A，几个B? +5 Tide man 2026-08-11 5/250 2026-08-12 09:24 by kangban
[论文投稿] 职称评审，求友友推荐见刊最快的期刊 +4 工厂打螺丝 2026-08-08 4/200 2026-08-12 09:18 by hansi2025
[基金申请] 有时候，自然基金真的不能太认真 （我的申报经验） +3 majunge000 2026-08-11 4/200 2026-08-11 20:13 by lch2012
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
[基金申请] 我的国基提前知道中了，可是同事的操作让我实在接受不了，怎么会有这样的人 +8 家与远方 2026-08-10 13/650 2026-08-11 09:49 by 家与远方
[基金申请] 关于代码变化问题，想知道的进来 +17 且听虎啸 2026-08-07 24/1200 2026-08-10 18:35 by zhangduo2008
[基金申请] 静等基金结果 +5 gjjjzhong 2026-08-10 16/800 2026-08-10 17:19 by Tide man
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
[基金申请] 2026国自然放榜时间 +9 布布和一二 2026-08-08 9/450 2026-08-10 11:22 by xxxx2020
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +11 布布和一二 2026-08-08 22/1100 2026-08-10 11:10 by wmfsnow
[基金申请] fileCode有新解读？ +10 Tide man 2026-08-08 18/900 2026-08-09 12:55 by 仁砚薪传
[基金申请] 国基金的申报应该改成非等额制，评价高的钱多评价低的钱少，但是增加资助率 +7 a089 2026-08-07 7/350 2026-08-08 18:05 by gltch
[基金申请] 关于filecode +4 布布和一二 2026-08-07 7/350 2026-08-07 22:55 by zhanghaozhu
[基金申请] 化学口download_prp&fileCode的固定段好像这几天一直没变，有变的大神么？ +3 Tide man 2026-08-07 4/200 2026-08-07 22:39 by Tide man
[基金申请] 固定端突然变了，今天 +6 archvillain 2026-08-06 10/500 2026-08-07 16:03 by 医学老男孩
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
[基金申请] 大家散了吧，后缀研究没有意义，别浪费时间了，过好目前的每一天，不要焦虑 +5 Tide man 2026-08-06 7/350 2026-08-07 13:11 by 医学老男孩
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭