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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

[求助] mpiifort+mkl编译ELK运行问题求助已有1人参与

本人编译ELK,采用的是mpiifort(v11)+mkl(v10.2),编译过程没什么问题。问题在于运行过程,我尝试运行了test-001下面例子,计算得到的能量似乎和程序得到的能量有很大差异,如果不采用mkl而采用内置的lib就没有这个问题,但核心利用效率很低(程序如不考虑mkl_thread会按照k并行,如果采用mkl_thread则可以提升效率)。

另外,vasp采用mkl有时也会出现“正能值”的问题。这两个问题是否同一原因导致?(测试下来SIESTA并没有这样的问题)。

对于这些问题有什么解决方案?产生这些问题的原因是什么?从这个问题看,如果是自己写程序该注意些什么?
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

★ ★ ★ ★ ★
fzx2008: 金币+5, 谢谢补充 2014-09-12 14:40:02
问题已经解决, zfftifc_fftw.f90用mkl编译会出问题,不采用mkl即可。

非k点并行fft_lib用-lfftw3和-lfftw3_threads即可,编译前做如下设置(参照官网以12核心为例):
export OMP_NUM_THREADS=4
export OMP_NESTED=true
export OMP_DYNAMIC=false
export MKL_NUM_THREADS=8
export MKL_DYNAMIC=true
这样即便gamma点也可以并行。
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3楼2014-09-12 13:55:02
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

忘说了,计算节点运行的时候也要设置环境
export OMP_NUM_THREADS=4
export OMP_NESTED=true
export OMP_DYNAMIC=false
export MKL_NUM_THREADS=8
export MKL_DYNAMIC=true
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4楼2014-09-12 13:57:05
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卡开发发

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Ab Initio Amateur

引用回帖:
5楼: Originally posted by 锐利的碎片 at 2014-09-12 16:28:26
mkl编译要用zfftifc…mkl.f90

用了,但是这样会报错,如果用的fftw3的话还是要fftw结尾的。
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6楼2014-09-12 17:03:49
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