| 查看: 1389 | 回复: 8 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
cyanobacter金虫 (小有名气)
|
[求助]
求高人指点，用什么命令可以在本地库中提取需要的序列文件？ 已有2人参与
|
|
|
各位虫友，我最近在分析高通量数据，这些数据中有处理组和对照组的，从sample ID中不能直接区分（因为我的样品全部由1,2,3,4排序的），通过mapping file信息可以分开为Ck和treatment。 我想问的是，通过什么命令可以从我的库序列中分别把treatment和CK的序列提取出来，分别作分析？ |
回复此楼» 猜你喜欢
湖北师范大学招调剂啦
已经有9人回复
-
邵阳学院食品与化学工程学院硕士调剂
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有164人回复
-
天津商业大学 生物与医药课题组招生
已经有0人回复
-
生物化工学硕招收调剂
已经有0人回复
-
广东石油化工学院2026年硕士研究生需要多名生物，制药工程，食品专业的调剂生
已经有0人回复
-
化工申博
已经有3人回复
-
申博自荐
已经有3人回复
-
广西民族大学化学化工学院化学工程与技术学硕，材料化工专硕调剂名额充足！
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 请求高手指点：玉米基因启动子序列查找、特定基因上游序列获得方法
已经有16人回复
cyanobacter
金虫 (小有名气)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 639.8
- 散金: 50
- 红花: 4
- 帖子: 153
- 在线: 220.6小时
- 虫号: 1083494
- 注册: 2010-08-27
- 专业: 环境微生物学
7楼2014-09-12 19:38:51
liuderong
铁杆木虫 (正式写手)
- 应助: 310 (大学生)
- 金币: 8202.1
- 红花: 31
- 帖子: 582
- 在线: 142.1小时
- 虫号: 1882145
- 注册: 2012-07-07
- 性别: GG
- 专业: 生物化学
2楼2014-09-11 08:54:17
cyanobacter
金虫 (小有名气)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 639.8
- 散金: 50
- 红花: 4
- 帖子: 153
- 在线: 220.6小时
- 虫号: 1083494
- 注册: 2010-08-27
- 专业: 环境微生物学
3楼2014-09-11 10:48:31
liuderong
铁杆木虫 (正式写手)
- 应助: 310 (大学生)
- 金币: 8202.1
- 红花: 31
- 帖子: 582
- 在线: 142.1小时
- 虫号: 1882145
- 注册: 2012-07-07
- 性别: GG
- 专业: 生物化学
★ ★
cyanobacter(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-09-11 15:55:02
cyanobacter(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-09-11 15:55:02
|
你用的是不是unix系统啊？你说的好多名词我都不懂！以你截图的数据为例，我对你的问题是这样理解的：图中表格一共有5列，你希望根据最后一列treatment将表格分成control、treatment1、treatment2这3个部分，每一个部分都保存到新的表格里，分类结果是D1和D5独立成一个文件，D2、6、7、8成另一个文件，其他的再一个文件。如果我理解得没错的话，那我自己会用MySQL或者perl来分类，我不知道你们用什么软件管理数据库的，所以不清楚你所说的代码或者指令。 |
4楼2014-09-11 11:29:51