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cyanobacter金虫 (小有名气)
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求高人指点，用什么命令可以在本地库中提取需要的序列文件？ 已有2人参与
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各位虫友，我最近在分析高通量数据，这些数据中有处理组和对照组的，从sample ID中不能直接区分（因为我的样品全部由1,2,3,4排序的），通过mapping file信息可以分开为Ck和treatment。 我想问的是，通过什么命令可以从我的库序列中分别把treatment和CK的序列提取出来，分别作分析？ |
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cyanobacter(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-09-11 15:55:02
cyanobacter(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-09-11 15:55:02
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你用的是不是unix系统啊？你说的好多名词我都不懂！以你截图的数据为例，我对你的问题是这样理解的：图中表格一共有5列，你希望根据最后一列treatment将表格分成control、treatment1、treatment2这3个部分，每一个部分都保存到新的表格里，分类结果是D1和D5独立成一个文件，D2、6、7、8成另一个文件，其他的再一个文件。如果我理解得没错的话，那我自己会用MySQL或者perl来分类，我不知道你们用什么软件管理数据库的，所以不清楚你所说的代码或者指令。 |
4楼2014-09-11 11:29:51
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