| 查看: 2744 | 回复: 18 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[交流]
Affymetrix表达谱芯片数据如何跨平台比较?探针如何对应?
|
|||
|
比如我用GPL570平台,Affymetrix HG-U133_Plus_2做的表达谱数据,找出了异常表达的基因探针。但是我又需要查找这些探针在GPL96平台,HG-U133A下的对应探针,即跨平台探针比较。 我现在的做法是利用Affymetrix网站的Query Search,先把HG-U133_Plus_2的探针找出对应的Gene Symbol,然后再反过来找对应的HG-U133A探针。可是这里面出现一个问题,就是两个平台的探针不再是一一对应关系。当然,它们可以不一一对应,可问题是当出现一个HG-U133_Plus_2的探针对应于多个HG-U133A探针时,是全部留下还是如何取舍呢?从Affymetrix网站“Home > Support > Microarray Technical Documentations > Array Comparison ”找了一圈,说是探针比较可以有Good match和Best match。如果能对上Best match那当然是好,可是不属于这两种情况下,又该怎么看比较结果呢? 总之一句话,我就是想把HG-U133_Plus_2的探针对应到HG-U133A,如何做到?出现一对多的情况下,如何取舍? 因为本人刚接触表达谱,不知道我的问题是不是很业余,请海涵,谢谢指教! |
» 猜你喜欢
蛋白质检测:精准分析,解锁生物分子的密码
已经有0人回复
不合理蛙科研实验之小鼠实验:严谨设计,解析生命机制的重要载体
已经有0人回复
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有149人回复
不合理蛙科研实验之重金属检测:精准筛查,守护健康与环境的防线
已经有0人回复
不合理蛙科研实验之“蛙测重金属我背锅三千”
已经有0人回复
不合理蛙科研实验之“鼠逃三次我发三篇SCI”
已经有0人回复
纳米粒度分析
已经有3人回复
林科院林化所招收材料与化工专业硕士,坐标南京
已经有0人回复
留学--博士招生
已经有15人回复
化学工程,本211,求调剂,ab区不限
已经有4人回复
» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:
数字基因表达谱后续工作
已经有24人回复
有没有人做过植物基因表达谱?怎么从公司给出的分析结果中挖掘数据呢?
已经有10人回复
下载芯片数据后,如何制作自己所需基因的表达谱?
已经有4人回复
基因芯片表达谱分析领域会过时淘汰吗?
已经有11人回复
【资料】Affymetrix基因表达谱芯片操作指南(中文版)
已经有124人回复
【求助/交流】基因芯片哪个公司做得好?多少钱一张?
已经有19人回复
生物信息学专题-生物版,医学版和信息科学版共同创建
已经有87人回复
» 抢金币啦!回帖就可以得到:
人生已过半程,不惑之年渐近,回望来时路,满心皆是感恩。
+5/1495
武汉征男友
+1/273
澳门科技大学创新工程学院诚招博士生
+2/134
求助有机化学第二版陆阳申东升主编课件或者电子版书籍
+1/84
南方医科大学中药学院 调剂硕士生一名 中药学专业
+1/84
南方科技大学王鹏团队诚聘药物化学、化学探针、药物递送博士后
+1/79
武汉纺织大学全重硕士调剂
+1/36
西华大学材料学院表面科学与工程技术科研团队2026年招收研究生
+1/33
上海交大招聘高分子方向博士后及科研助理
+1/30
南京医科大学-谭磊课题组-诚招博士后
+1/10
武汉工程大学资源生物技术课题组生物/环境/化工/矿冶专业硕士、博士研究生招生及调剂
+1/9
苏州高校招收08方向调剂
+1/9
化学、化工、化妆品、材料背景考生调剂
+1/8
宁夏大学化学化工学院魏逸彬研究员课题组招聘启事
+1/7
欢迎各位同学申请参加澳门大学健康科学学院的2026年夏令营,报名截止4月12号
+1/6
山东济南省属重点高校,生态环境类硕士招生 调剂 信息
+1/6
5科大招收材料专业硕士
+1/3
26年环境博士申请
+1/3
北京石油化工学院康举老师团招2026年研究生复试调剂考生,欢迎联系,
+1/3
香港大学 化学系 博后招聘
+1/1
18楼2014-09-09 10:14:59
简单回复
假大空6楼
2014-09-08 16:33
回复
Movchan(金币+2): 谢谢参与

















回复此楼
送红花一朵