| 查看: 2747 | 回复: 18 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[交流]
Affymetrix表达谱芯片数据如何跨平台比较？探针如何对应？
|
|||
|
比如我用GPL570平台，Affymetrix HG-U133_Plus_2做的表达谱数据，找出了异常表达的基因探针。但是我又需要查找这些探针在GPL96平台，HG-U133A下的对应探针，即跨平台探针比较。 我现在的做法是利用Affymetrix网站的Query Search，先把HG-U133_Plus_2的探针找出对应的Gene Symbol，然后再反过来找对应的HG-U133A探针。可是这里面出现一个问题，就是两个平台的探针不再是一一对应关系。当然，它们可以不一一对应，可问题是当出现一个HG-U133_Plus_2的探针对应于多个HG-U133A探针时，是全部留下还是如何取舍呢？从Affymetrix网站“Home > Support > Microarray Technical Documentations > Array Comparison ”找了一圈，说是探针比较可以有Good match和Best match。如果能对上Best match那当然是好，可是不属于这两种情况下，又该怎么看比较结果呢？ 总之一句话，我就是想把HG-U133_Plus_2的探针对应到HG-U133A，如何做到？出现一对多的情况下，如何取舍？ 因为本人刚接触表达谱，不知道我的问题是不是很业余，请海涵，谢谢指教！  |
回复此楼» 猜你喜欢
蛋白质检测：精准分析，解锁生物分子的密码
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之小鼠实验：严谨设计，解析生命机制的重要载体
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有93人回复
-
不合理蛙科研实验之重金属检测：精准筛查，守护健康与环境的防线
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“蛙测重金属我背锅三千”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“鼠逃三次我发三篇SCI”
已经有0人回复
-
纳米粒度分析
已经有3人回复
-
林科院林化所招收材料与化工专业硕士，坐标南京
已经有0人回复
-
留学--博士招生
已经有15人回复
-
化学工程，本211，求调剂，ab区不限
已经有4人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 数字基因表达谱后续工作
已经有24人回复
- 有没有人做过植物基因表达谱？怎么从公司给出的分析结果中挖掘数据呢？
已经有10人回复
- 下载芯片数据后，如何制作自己所需基因的表达谱？
已经有4人回复
- 基因芯片表达谱分析领域会过时淘汰吗？
已经有11人回复
- 【资料】Affymetrix基因表达谱芯片操作指南（中文版）
已经有124人回复
- 【求助/交流】基因芯片哪个公司做得好？多少钱一张？
已经有19人回复
- 生物信息学专题－生物版，医学版和信息科学版共同创建
已经有87人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
【招聘】温州医科大学/附属医院/瓯江实验室李校堃院士团队诚聘博士后和科研人员
+1/195
-
浙江省人民医院博士后岗位招聘
+1/37
-
西安工程大学能源化工新材料研发项目组接收2026年计算机类调剂研究生
+1/22
-
北京石油化工学院智能防腐涂层课题组招收2026级调剂研究生
+1/16
-
双一流湘潭大学化工学院招收化工、能源动力、工程热物理相关研究生调剂
+1/11
-
烟台大学先进陶瓷方向 招收材料专业调剂研究生
+1/11
-
南京医科大学-谭磊课题组-诚招博士后
+1/10
-
诚聘博士科研人员（有机合成化学方向）
+1/10
-
【博士招生】天津理工大学国家杰青王铁课题组招收2026年博士研究生
+1/9
-
课题组招收专业代码08开头的学硕！
+1/9
-
shu湘潭大学化工学院招收化工、能源动力、工程热物理相关研究生调剂
+1/8
-
机械求调剂 读研还想学机械
+1/5
-
大湾区大学张效勇课题组诚招理论和计算化学方向2026级博士研究生和博士后
+1/5
-
上海交大招收26年级秋季入学博士生，CET-6过，生物医用材料方向（有高分子合成基础）
+1/4
-
天津工业大学双一流高校招博士、硕士、博士后
+1/4
-
中科院科研助理招聘
+1/3
-
湖南农业大学 环境科学与工程0830+资源与环境专硕0857 调剂名额
+1/3
-
085602调剂
+1/1
-
一志愿西南交大机械专硕343求调剂
+1/1
-
天津大学福州校区｜学长推荐上岸新思路
+1/1
送红花一朵 
18楼2014-09-09 10:14:59
简单回复
假大空6楼
2014-09-08 16:33
回复
Movchan(金币+2): 谢谢参与
