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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 晶体表面吸附
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fentuo1203

新虫 (初入文坛)

[交流] 晶体表面吸附 已有2人参与

各位大师：
      本人正在做乙醇分子在二氯化镍晶体表面的吸附模拟，我的做法是：
1、根据Find2009得到二氯化镍晶体参数，并在MS中进行绘图，随后优化晶胞。
2、对晶胞进行切面，构建2*2超级胞，并进行优化。
3、对乙醇分子进行优化。
4、将乙醇分子挪至晶胞切面真空层中，进行优化。
问题：
    第四步，我始终无法做到SCF值收敛，一直都在零点几到一点几之间变化，即便是加大循环也是如此。因此，我猜想是否是乙醇分子放置位置不对，如果是这样，该如何放置。
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1楼 2014-09-04 00:38:20
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月只蓝

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SCF不收敛的可能原因有很多，近似函数选用不合理、参数设置不合理等都会造成SCF不收敛。此外，可以试试增加迭代次数。
如果怀疑手动放置分子位子不对，可以先跑一下分子动力学，确定乙醇分子的位置，在跑量子力学。
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jingjing1023
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助！时间精力有限，恕不接受无偿私信求助。
2楼2014-09-04 08:40:53
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jingjing1023

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2楼: Originally posted by 月只蓝 at 2014-09-04 08:40:53
SCF不收敛的可能原因有很多，近似函数选用不合理、参数设置不合理等都会造成SCF不收敛。此外，可以试试增加迭代次数。
如果怀疑手动放置分子位子不对，可以先跑一下分子动力学，确定乙醇分子的位置，在跑量子力学。

你好，我想问下，用动力学跑过的结构，能直接导入到castep中做吸附计算吗？谢谢
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3楼2014-09-17 10:30:49
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月只蓝

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3楼: Originally posted by jingjing1023 at 2014-09-17 10:30:49
你好，我想问下，用动力学跑过的结构，能直接导入到castep中做吸附计算吗？谢谢...

分子动力学？
最好先用CASTEP做几何优化，再进行下一步。
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4楼2014-09-17 11:25:42
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jingjing1023

铜虫 (小有名气)
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4楼: Originally posted by 月只蓝 at 2014-09-17 11:25:42
分子动力学？
最好先用CASTEP做几何优化，再进行下一步。...

用CASTEP建吸附模型的时候，不知道要怎么建，我想做红柱石表面与油酸钠的吸附
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5楼2014-09-17 18:20:45
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jingjing1023

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4楼: Originally posted by 月只蓝 at 2014-09-17 11:25:42
分子动力学？
最好先用CASTEP做几何优化，再进行下一步。...

首先，谢谢你的回复，我还有一个问题：用CASTEP建吸附模型的时候，不知道要怎么建，我想做红柱石表面与油酸钠的吸附，没有找到相关文献，大神，给指点下啊，谢谢！
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6楼2014-09-17 18:22:44
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月只蓝

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6楼: Originally posted by jingjing1023 at 2014-09-17 18:22:44
首先，谢谢你的回复，我还有一个问题：用CASTEP建吸附模型的时候，不知道要怎么建，我想做红柱石表面与油酸钠的吸附，没有找到相关文献，大神，给指点下啊，谢谢！...

相关文献肯定是有的，但要文献也是做红柱石表面与油酸钠吸附的，不一定有。
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7楼2014-09-17 18:44:28
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