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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 超晶格结构原子弛豫优化出问题
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jk射手座

新虫 (著名写手)

[求助] 超晶格结构原子弛豫优化出问题已有1人参与

今天突然碰上这么个问题，优化2层、4层结构的钛酸铅和铌酸钾的超晶格没问题，但是3:3 4:4 5:5 的结构就出现优化后的能量 的值成千上万、有正有负。。显然是出错误的，已经找过很多原因，; 现在还是在不停的改参数测试中，之余来这里求教一下有没有遇到过类似情况的同僚；nohup中有提示，虽然就是那个老生常谈的 Segmentation Fault ，但是我不理解为什么我n：n （n=1~5）的钛酸铅和铝酸镧结构都没任何问题，怎么铌酸钾的这么尴尬呢？
附带说一下，用的都是PAW赝势
INCAR:
SYSTEM=PTOKNO
ENCUT=450
PREC=Normal
ISMEAR=0
SIGMA=0.05
IBRION=7
ISTART=0
ICHARG=2
EDIFF=1E-3
ISIF=2
NSW=200

KPOINTS:
Auto-generate
0
Monkhorst-Pack
6 6 2
0 0 0

脚本：
#!/bin/bash
#for ps in 0.5 10 20 30 50 100 150 200 250 300 350 400 450 500 550 600; do
for c in 23.5026 23.5224 23.74 23.76; do
cat > POSCAR <<!
data_PTOKNO
1.0
3.89 0.00 0.00
0.00 3.89 0.00
0.00 0.00 $c
3 3 3 3 18
Selective dynamics
Direct
0.000 0.000 0.000 F F T
0.000 0.000 0.167 F F T
0.000 0.000 0.333 F F T
0.500 0.500 0.083 F F T
0.500 0.500 0.250 F F T
0.500 0.500 0.417 F F T
0.000 0.000 0.500 F F T
0.000 0.000 0.667 F F T
0.000 0.000 0.833 F F T
0.500 0.500 0.583 F F T
0.500 0.500 0.750 F F T
0.500 0.500 0.917 F F T
0.500 0.000 0.083 F F T
0.000 0.500 0.083 F F T
0.500 0.500 0.000 F F T
0.500 0.000 0.250 F F T
0.000 0.500 0.250 F F T
0.500 0.500 0.167 F F T
0.500 0.000 0.417 F F T
0.000 0.500 0.417 F F T
0.500 0.500 0.333 F F T
0.500 0.000 0.583 F F T
0.000 0.500 0.583 F F T
0.500 0.500 0.500 F F T
0.500 0.000 0.750 F F T
0.000 0.500 0.750 F F T
0.500 0.500 0.667 F F T
0.500 0.000 0.917 F F T
0.000 0.500 0.917 F F T
0.500 0.500 0.833 F F T
!
/public/jzh/vasp5
cp CONTCAR CONTCAR$c
cp OUTCAR OUTCAR$c
grep "TOTEN" OUTCAR | tail -1 >>E.dat
done

麻烦懂的帮看一下，我自己现在也在找解决方法，共同讨论
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主做电弧增材制造方向
1楼2014-09-02 16:10:04
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jk射手座

新虫 (著名写手)
先自顶，顺便再说一下，小弟查了Segmentation Fault 的原因和一些解决办法，但是全是太专业的计算机知识，本人IT 低能，如果说非要从硬件着手解决，那也真是没办法啊、、、、、
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主做电弧增材制造方向
2楼2014-09-02 16:12:20
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jpchou

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
fzx2008: 金币+3, 谢谢指导 2014-09-02 19:16:22
jk射手座: 金币+5, ★有帮助 2014-09-04 09:33:52
為什麼你的 IBRION = 7 ??
根據手冊上指出
IBRION=7 and IBRION=8 is only supported starting from VASP.5.1. It determines the Hessian matrix (matrix of second derivatives) using density functional perturbation theory.
你要算 Hessian matrix ?

可是看你的腳本
你似乎是在確認 z 方向的長度，不是嬤?
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3楼2014-09-02 17:38:52
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jk射手座

新虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by jpchou at 2014-09-02 17:38:52
為什麼你的 IBRION = 7 ??
根據手冊上指出
IBRION=7 and IBRION=8 is only supported starting from VASP.5.1. It determines the Hessian matrix (matrix of second derivatives) using density functional pert ...

哦哦，忘了说明，IBRION我之前一直是用的2，包括之前算的结构和PTO/LAO 的5种比例也是用的2，但是含铌酸钾的因为一直出错，所以我在试试改IBRION能不能解决，不过经过计算，7和8都不行，好像不是IBRION的问题，我还要再想想。请问你遇到过这个问题吗？能量值巨大
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主做电弧增材制造方向
4楼2014-09-03 08:40:47
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jpchou

专家顾问 (著名写手)
有遇過
能量巨大，或是能量變成負號
都是因為 VASP 沒有編好
MKL 或 MPI 的問題
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5楼2014-09-03 13:41:52
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jk射手座

新虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by jpchou at 2014-09-03 13:41:52
有遇過
能量巨大，或是能量變成負號
都是因為 VASP 沒有編好
MKL 或 MPI 的問題

嗯，我查找相关的解决办法也有很多说是编译器等级的问题，但这个我实在是没办法。上午又试了下，把那三个出错的结构用了GGA的POTCAR， 结果好了，反正是优化晶格参数，先这样吧，不然太耽误时间了。
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主做电弧增材制造方向
6楼2014-09-03 14:59:22
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