24小时热门版块排行榜    

查看: 6513  |  回复: 15

Illusionist

银虫 (正式写手)

[求助] 如何做vasp掺杂

本人想用vasp做掺杂计算,刚开始学

1.直接建立3x3x3的超晶格模型
1)关于K的选择
3x3x3   -1019.397709
4x4x4   -1019.397873
所以选择了3x3x3
2)ENCUT
280   4093.144030
300   4093.144030
320   4093.144030
340   4093.144030
这里我最后选择了500ENCUT去进行结构优化。



2.结构优化INCAR:
SYSTEM=SnO2
ENCUT=500
ISMEAR=-5
GGA=91
VOSKOWN=1
ISYM=0
ISIF=3
NSW=100
PTIOM=0.1
IBRION=2
这里我选择打破对称性不知道是否合理
ISYM=0设置前后影响挺大,起码晶格常数会变化。LREAL=auto设置后,晶格常数也会有明显变化,请问一下一般如何处理这样的问题

另外我想在这一步结束后掺入替位的Sb,但是Sb有+3和+5价之分,该如何设定价态呢
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

贺仪

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流。。。 2012-05-14 21:28:25
引用回帖:
6楼: Originally posted by Illusionist at 2012-05-14 14:40:13:
关键是掺杂前后要进行能量的比较,得到形成能。
掺杂之后对称性就改变了,如果不打破对称性,我担心对称性本身会对能量产生差异。

掺杂之后对称性就改变了,
你要比较掺杂和没有掺杂是的能量是吧?
是否对称计算只是在计算的时候使用对称性减小计算量而已 对能量这些影响不大
嘟啦啦嘟啦啦嘟
7楼2012-05-14 20:57:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

贺仪

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
Illusionist: 金币+20 2012-05-14 14:40:37
liliangfang: 金币+2, 谢谢指教 2012-05-14 14:59:36
首先对你的数据:
2)ENCUT
280   4093.144030
300   4093.144030
320   4093.144030
340   4093.144030
表示怀疑

其次对称性没必要打破,设置isif=3就可以了
嘟啦啦嘟啦啦嘟
5楼2012-05-14 14:32:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dxf_dxf_dxf

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
fzx2008: 金币+3, 谢谢指教 2012-05-17 14:57:51
引用回帖:
9楼: Originally posted by dxf_dxf_dxf at 2012-05-17 00:07:44:
掺杂的问题,建议把K格点设成只有Gamma点,再用更大的晶格(例如4x4x4,5x5x5,6x6x6等)。
至于收敛性测试,要注意收敛条件是,而不是
在优化几何结构的时候,建议不要使用ISIF=3选项!速度会非常慢。在同样的计算 ...

先在1x1x1体系下用ISIF=7优化得到粗略的晶格常数
然后做ENCUT和KPOINTS的收敛性测试
按满足收敛条件的ENCUT和KPOINTS值,计算不同晶格常数下体系的能量
用murn.f拟合得到平衡态晶格常数。
把1x1x1体系按比例放大,得到2x2x2/3x3x3/4x4x4等体系。
对3x3x3体系:
KPOINTS设成
CODE:
K-Points
0
Monkhorst Pack
1 1 1
0  0  0

然后进行ENCUT收敛性测试,记录不同ENCUT情况下能量和cpu time
然后在4x4x4x体系下做同样的事情,记录不同ENCUT情况下能量和cpu time
再重复至5x5x5,6x6x6,7x7x7
计算时间超过48小时的任务就可以忽略了。
综合考虑性能和精度的影响,确定最后选用的掺杂体系,例如我就选用4x4x4体系。
在此体系下,加入掺杂原子,按照之前收敛性测试的结果设置ENCUT
接下来就开始几何优化了。这里一般要求保持原胞的形状和体积,不过你也可以先优化原胞的体积,一般不要优化原胞的形状。不过这也说不定,例如极高压情况中体系的晶格会改变(例如从体心立方变成六角密堆,所以原胞形状是否改变跟你所做的具体工作有关。)
优化好原胞以后再做离子迟豫。你可以自己写脚本计算,也可以让vasp自己算。
12楼2012-05-17 13:44:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

xueht987

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
uuv2010: 金币+1, 多谢指导 2012-05-14 14:14:10
Illusionist: 金币+20, ★★★很有帮助 2012-05-14 14:16:09
首先打破对称性是可以的,只不过计算可能会多费点时间;
至于替位掺杂,要考虑一下掺杂原子与被掺杂原子是否是等价的,若果是非等价掺杂要考虑电荷补偿的问题,相关参数是NELECT,具体关于这方面之前本版有很多的相关帖子可以参考,自己搜一下。
2楼2012-05-14 14:13:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Illusionist

银虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by xueht987 at 2012-05-14 14:13:29:
首先打破对称性是可以的,只不过计算可能会多费点时间;
至于替位掺杂,要考虑一下掺杂原子与被掺杂原子是否是等价的,若果是非等价掺杂要考虑电荷补偿的问题,相关参数是NELECT,具体关于这方面之前本版有很多的 ...

打破对称性之后是否需要提高ENCUT?因为我打破之后,发现晶格常数变大了许多·······3.18变到了3.21左右
3楼2012-05-14 14:15:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xueht987

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
贺仪: 金币+2, 谢谢指教! 2012-05-14 14:29:32
Illusionist: 金币+10, ★★★很有帮助, 谢谢,我再看看··有什么问题 2012-05-14 14:36:36
引用回帖:
3楼: Originally posted by Illusionist at 2012-05-14 14:15:57:
打破对称性之后是否需要提高ENCUT?因为我打破之后,发现晶格常数变大了许多·······3.18变到了3.21左右

只要是收敛的,我个人觉得不需要;至于膨胀可与实验值比较一下,一般在1.5%内都可以接受,甚至更大。
4楼2012-05-14 14:25:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Illusionist

银虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 贺仪 at 2012-05-14 14:32:59:
首先对你的数据:
2)ENCUT
280   4093.144030
300   4093.144030
320   4093.144030
340   4093.144030
表示怀疑

其次对称性没必要打破,设置isif=3就可以了

关键是掺杂前后要进行能量的比较,得到形成能。
掺杂之后对称性就改变了,如果不打破对称性,我担心对称性本身会对能量产生差异。
6楼2012-05-14 14:40:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liu108

木虫 (正式写手)


WDD880227: 金币+1, 感谢提示 2012-05-17 08:37:57
对于VASP计算参杂的问题,一个重要的因素是建模的问题,参杂未知一般选择在晶格缺陷的位置。对于参杂后体系的计算没必要做大的改动,可以选择跟未参杂的体系做对比来做。
会当凌绝顶,一览众山小。
8楼2012-05-14 21:03:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dxf_dxf_dxf

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
fzx2008: 金币+2, 谢谢指教 2012-05-17 08:38:22
Illusionist: 金币+20, ★★★很有帮助, Gamma计算什么,结构优化还是收敛测试?对于K空间的gamma点对应的应该是是空间的晶格边界还是中心,掺杂的时候最好不要放在边间还是中心? 2012-05-17 08:48:09
掺杂的问题,建议把K格点设成只有Gamma点,再用更大的晶格(例如4x4x4,5x5x5,6x6x6等)。
至于收敛性测试,要注意收敛条件是
引用回帖:
0.1meV/原子

,而不是
引用回帖:
0.1meV

在优化几何结构的时候,建议不要使用ISIF=3选项!速度会非常慢。在同样的计算条件下,建议用loop.sh方案。
一般来说,先在1x1x1体系下在实验测得的晶格常数基础上用ISIF=7优化得到体系的晶格常数。
然后作等比例放大,得到nxnxn体系的POSCAR,然后用循环静态计算这个晶格常数附近几个值对应的体系的能量,用murn方程拟合得到体系的平衡态晶格常数。
9楼2012-05-17 00:07:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dxf_dxf_dxf

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by xueht987 at 2012-05-14 14:13:29:
首先打破对称性是可以的,只不过计算可能会多费点时间;
至于替位掺杂,要考虑一下掺杂原子与被掺杂原子是否是等价的,若果是非等价掺杂要考虑电荷补偿的问题,相关参数是NELECT,具体关于这方面之前本版有很多的 ...

这个样子啊,能详细解释一下么,我很感兴趣!
10楼2012-05-17 00:09:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 Illusionist 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +14 ziyangfang 2026-08-19 17/850 2026-08-24 18:37 by 哈哈蛤?
[基金申请] 号外号外 +5 GZUZM 2026-08-24 5/250 2026-08-24 18:34 by 40862026
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +20 koalala 2026-08-24 22/1100 2026-08-24 18:01 by Nano-Firefly
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +6 图啦图啦 2026-08-24 6/300 2026-08-24 17:44 by 小小红帆
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +5 scalable 2026-08-24 5/250 2026-08-24 17:03 by spiderzhuzhi
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +17 羊腰板 2026-08-21 19/950 2026-08-24 16:52 by iaeyuan
[基金申请] 估计是周四 +4 archvillain 2026-08-18 4/200 2026-08-24 13:53 by zzuzxg
[基金申请] 我面上完蛋了 +8 且听虎啸 2026-08-20 9/450 2026-08-24 13:52 by zzuzxg
[基金申请] 朋友圈看到的 +7 wangzilk 2026-08-18 9/450 2026-08-24 10:50 by cmrandy
[基金申请] 明天应该可查了!? +4 chengyan1220 2026-08-23 4/200 2026-08-24 08:47 by gloomy6159
[基金申请] 什么时候开奖? +10 CrisMessi 2026-08-18 11/550 2026-08-24 06:50 by 开心的小狮子
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +4 process2012 2026-08-23 5/250 2026-08-23 19:58 by jurkat.1640
[基金申请] 今天放榜吗? +15 布布和一二 2026-08-19 16/800 2026-08-23 09:55 by 张春生
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +24 yaoyewhu2008 2026-08-20 26/1300 2026-08-22 17:43 by kammury
[基金申请] 今天基金会出结果吗?20260819 +16 kkkl_v 2026-08-19 17/850 2026-08-22 16:12 by 阿布Abu
[基金申请] 时间戳今天,20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 看来今天不会放榜了? +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[论文投稿] 投稿咨询 +5 wwm09 2026-08-17 7/350 2026-08-21 10:11 by 期刊论文帮手
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
信息提示
请填处理意见