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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 溶液中的材料表面与晶体的相互作用
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smbluesea

金虫 (小有名气)

[求助] 溶液中的材料表面与晶体的相互作用 已有1人参与

本人菜鸟，材料表面与溶液中晶体的相互作用能，该做哪些参数计算，怎么做呢？
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1楼 2014-09-02 10:23:12
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月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
分子动力学后，计算相互作用能。
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smbluesea
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助！时间精力有限，恕不接受无偿私信求助。
2楼2014-09-02 10:31:47
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月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
smbluesea: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2014-09-02 13:55:49
引用回帖:
3楼: Originally posted by smbluesea at 2014-09-02 10:50:40
具体操作是不是 先Build晶体和表面层（CCDC导入？），然后Module/Discover/Dynamics? 还是Statics？

如果初始状态没有晶体，只是过饱和溶液，看表面对成核的诱导作用，又该怎么做呢？...

有机晶体CCDC数据库查，无机晶体ICSD数据查。
导入晶体，确认晶体结构无误。
确定晶体，一般选解离面、主要晶习面。
Cleave晶面，扩展。
根据需要，如果是考察单个溶剂分子，构建该分子后，docking到晶面；如果要在晶面上加溶剂层，则需用AC模块，构建溶剂层，然后用build layer，将该溶剂层叠放到晶面上方。
Module，选择Discover，运行Dynamics。
Dynamics结果分析，计算能量。
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MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助！时间精力有限，恕不接受无偿私信求助。
4楼2014-09-02 11:25:01
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月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by smbluesea at 2014-09-02 10:50:40
具体操作是不是 先Build晶体和表面层（CCDC导入？），然后Module/Discover/Dynamics? 还是Statics？

如果初始状态没有晶体，只是过饱和溶液，看表面对成核的诱导作用，又该怎么做呢？...

如果研究溶液中成核，晶面不需要了，估计要用AC模块构建溶液盒子。
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MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助！时间精力有限，恕不接受无偿私信求助。
5楼2014-09-02 11:26:37
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