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求助PAUP使用GTR+G+I模型建ML树，具体命令 已有3人参与
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| 建树小白一只。。。最近要用PAUP使用GTR+G+I替换模型构建ML树，从网上看相关教程一直云里雾里，希望大虫能帮帮忙，给出具体命令行供学习。非常感谢！ |
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6楼2016-03-08 16:10:24
lingonghua
铁杆木虫 (正式写手)
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【答案】应助回帖
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感谢参与，应助指数 +1
qcmjxmc(kx444555代发): 金币+3, 鼓励交流 2014-09-09 09:54:40
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用modeltest软件可直接生成命令行，将其拷到序列文件之后即可。例： BEGIN PAUP; Lset Base=(0.2430 0.0266 0.2287) Nst=6 Rmat=(644843.0000 163043.4531 2960.3882 464968.3750 2308065.0000) Rates=gamma Shape=0.4289 Pinvar=0.4903; outgroup H_dim; END; |
2楼2014-08-30 15:03:10
3楼2014-09-09 08:58:13
Crescendo
铁杆木虫 (著名写手)
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- 虫号: 989569
- 注册: 2010-04-05
- 性别: GG
- 专业: 植物病理学
4楼2015-05-13 16:49:36
