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小小幻想

新虫 (初入文坛)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 148.5
帖子: 17
在线: 14.1小时
虫号: 1262333
注册: 2011-04-11
性别: MM
专业: 生化分析及生物传感

[求助] 请问30个长80bp的片段，如何在他们之中找4个碱基以上的相同区域已有1人参与

有30个80bp的序列，如何在他们之中找4个碱基以上的相同区域
例如序列1和2
1、AAGGTTAAAACG
2、ACTTAAAAGGCG
在DNA MAN软件商显示的是将所有序列对比起来的同源性什么的，我只想让某软件能发现序列1里面的TTAAAA和序列2里面的TTAAAA是相同的，但是1的TTAAAA是第5-10个碱基，2的TTAAAA是3-8个碱基。他们的起始位置不同。在DNA MAN软件上只能找到起始位置的相同片段。有什么软件能达到我的要求呢？

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