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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 核酸杂交 » 请问30个长80bp的片段，如何在他们之中找4个碱基以上的相同区域
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小小幻想

新虫 (初入文坛)

[求助] 请问30个长80bp的片段，如何在他们之中找4个碱基以上的相同区域 已有1人参与

有30个80bp的序列，如何在他们之中找4个碱基以上的相同区域
例如序列1和2
1、AAGGTTAAAACG
2、ACTTAAAAGGCG
在DNA MAN软件商显示的是将所有序列对比起来的同源性什么的，我只想让某软件能发现序列1里面的TTAAAA和序列2里面的TTAAAA是相同的，但是1的TTAAAA是第5-10个碱基，2的TTAAAA是3-8个碱基。他们的起始位置不同。在DNA MAN软件上只能找到起始位置的相同片段。有什么软件能达到我的要求呢？
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失败是成功之母。不要怕失败！只要努力！
1楼 2014-08-25 21:02:28
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bwangel

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
小小幻想(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-08-25 22:41:20
有个小软件BioXM 2.6就能玩你这个要求貌似，可以去试试
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2楼2014-08-25 22:38:08
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