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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 如何修改从Gaussview得到的分子中特定原子的颜色
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势在必行

新虫 (初入文坛)

[求助] 如何修改从Gaussview得到的分子中特定原子的颜色 已有1人参与

我做高斯计算时优化得到了一个分子，需要对其中若干的H原子做标记并改成绿色。不知使用什么工具，希望知道的朋友能指点一二，不胜感激。红色的是两个Cr原子，在他们左边的就是两个氢。

如何修改从Gaussview得到的分子中特定原子的颜色
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势在必行

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1楼 2014-08-23 17:09:06
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zhou2009: 金币+3 2014-08-23 19:50:16
势在必行: 金币+5, ★★★很有帮助, 我试过了，成功了，谢谢。不过我还是希望能在另外一个工具里实现改变颜色的想法，所以没有给您最佳答案，抱歉！ 2014-08-23 21:21:18
没法设定单个原子的颜色，只能设元素的颜色。
如果你想高亮某几个原子，可以在左侧的builder子界面里选择箭头工具，然后点击相应原子令之高亮，不过不是用绿色而是黄色高亮的。
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势在必行
2楼2014-08-23 18:02:12
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crosschannel

金虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 势在必行 at 2014-08-24 16:22:07
突然想到可以在Gaussview里用He原子替换H，他俩大小差不多大便不会被发现有什么不同，再把He元素用绿色标记就行了。嘿嘿。...

不要这样，太不严谨了，还是留着氢吧。就像楼上大侠说的，标记一下就好。你可以在GaussView里点edit菜单，然后选Atom list, 然后把你想标记的原子点highlight，就标记成蓝绿色的了
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势在必行
4楼2014-08-24 19:51:32
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nwwolfchj

金虫 (正式写手)
File-Preference-Colors(在左列中)-Element Colors-选择元素  这是全部改变的方法, 个别改变似乎不能，标记
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7楼2014-08-26 11:40:43
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赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
势在必行: 金币+5, ★★★★★最佳答案, 听过，我试试。谢谢 2014-08-31 16:42:40
做量化的人不得不知道的软件chem3D，针对你的问题，在GView里的图保存为gjf格式然后在chem3D里打开，原子的颜色、字母和数字标记都可以弄了，还可以调整键。
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9楼2014-08-29 16:26:09
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普通回帖

势在必行

新虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by sobereva at 2014-08-23 18:02:12
没法设定单个原子的颜色，只能设元素的颜色。
如果你想高亮某几个原子，可以在左侧的builder子界面里选择箭头工具，然后点击相应原子令之高亮，不过不是用绿色而是黄色高亮的。

突然想到可以在Gaussview里用He原子替换H，他俩大小差不多大便不会被发现有什么不同，再把He元素用绿色标记就行了。嘿嘿。
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3楼2014-08-24 16:22:07
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势在必行

新虫 (初入文坛)
送红花一朵
嗯，好的。谢谢！！！
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5楼2014-08-25 16:54:56
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势在必行

新虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by crosschannel at 2014-08-24 19:51:32
不要这样，太不严谨了，还是留着氢吧。就像楼上大侠说的，标记一下就好。你可以在GaussView里点edit菜单，然后选Atom list, 然后把你想标记的原子点highlight，就标记成蓝绿色的了...

知道了，谢谢！！！
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6楼2014-08-25 16:58:37
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势在必行

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
7楼: Originally posted by nwwolfchj at 2014-08-26 11:40:43
File-Preference-Colors(在左列中)-Element Colors-选择元素  这是全部改变的方法, 个别改变似乎不能，标记

嗯
8楼2014-08-29 10:37:52
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吧森521
引用回帖:
9楼: Originally posted by 赵红霞 at 2014-08-29 16:26:09
做量化的人不得不知道的软件chem3D，针对你的问题，在GView里的图保存为gjf格式然后在chem3D里打开，原子的颜色、字母和数字标记都可以弄了，还可以调整键。

10楼2014-10-25 13:25:13
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