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势在必行

新虫 (初入文坛)

[求助] 如何修改从Gaussview得到的分子中特定原子的颜色 已有1人参与

我做高斯计算时优化得到了一个分子,需要对其中若干的H原子做标记并改成绿色。不知使用什么工具,希望知道的朋友能指点一二,不胜感激。红色的是两个Cr原子,在他们左边的就是两个氢。

如何修改从Gaussview得到的分子中特定原子的颜色
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫


【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zhou2009: 金币+3 2014-08-23 19:50:16
势在必行: 金币+5, ★★★很有帮助, 我试过了,成功了,谢谢。不过我还是希望能在另外一个工具里实现改变颜色的想法,所以没有给您最佳答案,抱歉! 2014-08-23 21:21:18
没法设定单个原子的颜色,只能设元素的颜色。
如果你想高亮某几个原子,可以在左侧的builder子界面里选择箭头工具,然后点击相应原子令之高亮,不过不是用绿色而是黄色高亮的。

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2楼2014-08-23 18:02:12
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crosschannel

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 势在必行 at 2014-08-24 16:22:07
突然想到可以在Gaussview里用He原子替换H,他俩大小差不多大便不会被发现有什么不同,再把He元素用绿色标记就行了。嘿嘿。...

不要这样,太不严谨了,还是留着氢吧。就像楼上大侠说的,标记一下就好。你可以在GaussView里点edit菜单,然后选Atom list, 然后把你想标记的原子点highlight,就标记成蓝绿色的了

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4楼2014-08-24 19:51:32
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nwwolfchj

金虫 (正式写手)

File-Preference-Colors(在左列中)-Element Colors-选择元素  这是全部改变的方法, 个别改变似乎不能,标记
7楼2014-08-26 11:40:43
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赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
势在必行: 金币+5, ★★★★★最佳答案, 听过,我试试。谢谢 2014-08-31 16:42:40
做量化的人不得不知道的软件chem3D,针对你的问题,在GView里的图保存为gjf格式然后在chem3D里打开,原子的颜色、字母和数字标记都可以弄了,还可以调整键。
9楼2014-08-29 16:26:09
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普通回帖

势在必行

新虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by sobereva at 2014-08-23 18:02:12
没法设定单个原子的颜色,只能设元素的颜色。
如果你想高亮某几个原子,可以在左侧的builder子界面里选择箭头工具,然后点击相应原子令之高亮,不过不是用绿色而是黄色高亮的。

突然想到可以在Gaussview里用He原子替换H,他俩大小差不多大便不会被发现有什么不同,再把He元素用绿色标记就行了。嘿嘿。
3楼2014-08-24 16:22:07
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势在必行

新虫 (初入文坛)

送红花一朵
嗯,好的。谢谢!!!
5楼2014-08-25 16:54:56
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势在必行

新虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by crosschannel at 2014-08-24 19:51:32
不要这样,太不严谨了,还是留着氢吧。就像楼上大侠说的,标记一下就好。你可以在GaussView里点edit菜单,然后选Atom list, 然后把你想标记的原子点highlight,就标记成蓝绿色的了...

知道了,谢谢!!!
6楼2014-08-25 16:58:37
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势在必行

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by nwwolfchj at 2014-08-26 11:40:43
File-Preference-Colors(在左列中)-Element Colors-选择元素  这是全部改变的方法, 个别改变似乎不能,标记

8楼2014-08-29 10:37:52
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引用回帖:
9楼: Originally posted by 赵红霞 at 2014-08-29 16:26:09
做量化的人不得不知道的软件chem3D,针对你的问题,在GView里的图保存为gjf格式然后在chem3D里打开,原子的颜色、字母和数字标记都可以弄了,还可以调整键。

10楼2014-10-25 13:25:13
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