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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 请问如何描述单晶解析中的氢原子处理方法？
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cheap_81

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] 请问如何描述单晶解析中的氢原子处理方法？ 已有1人参与

审稿人说in the X-ray crystallography section, the treatment of hydrogen atoms (C-H and O-H) should be briefly described.
但晶体是请别人解的
我应该怎么描述？
谢谢了
cif文件能看到吧？
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1楼 2014-08-22 19:48:53
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我想更懂你29

专家顾问 (文坛精英)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
你看看你的X-ray crystallography section里有没有下面这个文献标注黄色的部分，另外看不到cif文件，找解晶体的老师问问，氢是怎么加的，理论加还是差值傅立叶加的 对准了在描述（一般N-H或者O-H都是差值傅立叶加的）
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    • 2014-08-22 20:13:49, 741.63 K
以大多数人的努力程度，还轮不到去拼天赋的地步
2楼2014-08-22 20:14:42
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cheap_81

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 我想更懂你29 at 2014-08-22 20:14:42
你看看你的X-ray crystallography section里有没有下面这个文献标注黄色的部分，另外看不到cif文件，找解晶体的老师问问，氢是怎么加的，理论加还是差值傅立叶加的 对准了在描述（一般N-H或者O-H都是差值傅立叶加的 ...

看了cif文件
_atom_sites_solution_hydrogens    geom
_refine_ls_hydrogen_treatment     mixed

这是什么意思呢？
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3楼2014-08-22 20:27:40
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我想更懂你29

专家顾问 (文坛精英)
引用回帖:
3楼: Originally posted by cheap_81 at 2014-08-22 20:27:40
看了cif文件
_atom_sites_solution_hydrogens    geom
_refine_ls_hydrogen_treatment     mixed

这是什么意思呢？...

_atom_sites_solution_hydrogens    geom 获得氢原子的方法
_refine_ls_hydrogen_treatment     mixed 结构精修中氢原子的处理方法
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以大多数人的努力程度，还轮不到去拼天赋的地步
4楼2014-08-22 21:34:48
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cheap_81

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 我想更懂你29 at 2014-08-22 21:34:48
_atom_sites_solution_hydrogens    geom 获得氢原子的方法
_refine_ls_hydrogen_treatment     mixed 结构精修中氢原子的处理方法...

我是问是不是符合以下的描述？
N−H and O−H hydrogens were located from
difference electron density maps, and C−H hydrogens were placed in
calculated positions and refined with a riding model.
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5楼2014-08-22 22:00:40
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我想更懂你29

专家顾问 (文坛精英)
引用回帖:
5楼: Originally posted by cheap_81 at 2014-08-22 22:00:40
我是问是不是符合以下的描述？
N−H and O−H hydrogens were located from
difference electron density maps, and C−H hydrogens were placed in
calculated positions and refined with a r ...

符合啊 ，mixed就是我说的涉及的两种方法，
要是你还不明白，就找解晶体的人问问，C-H一般几乎肯定是理论加的，问他O-H是不是差值傅立叶加的，是就符合
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6楼2014-08-22 22:49:34
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