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MichaelC

木虫 (小有名气)

[求助] diamond使用 已有1人参与

为什么用diamond画出来的晶体怎么和cif文件的不一致,有些cif文件里面没有的键自动生成了?有些应该是氢键,可是直接读取就出现了,不是氢键的模式了。
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MichaelC

木虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 我想更懂你29 at 2014-08-21 16:40:39
氢键在这里显示不出来,build   create H-bonds 然后给出氢键键长和键角(lst文件里面有),选择给体和受体添加氢键...

我的cif文件里面两个原子是没有键的,但是读取画图后自动默认的连上了,显示的的不是氢键,距离远的的距离近的都有连上,是默认设置的原因吗?

[ 发自小木虫客户端 ]
5楼2014-08-23 09:45:14
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我想更懂你29

专家顾问 (文坛精英)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
点击Build-Connectivity-evaluate,可以对键长进行合理的设置
以大多数人的努力程度,还轮不到去拼天赋的地步
2楼2014-08-21 11:14:38
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MichaelC

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 我想更懂你29 at 2014-08-21 11:14:38
点击Build-Connectivity-evaluate,可以对键长进行合理的设置

有些原子间距离近,但是它们之间是氢键,这个键长设置的在这里就不合理了
3楼2014-08-21 15:48:59
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我想更懂你29

专家顾问 (文坛精英)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by MichaelC at 2014-08-21 15:48:59
有些原子间距离近,但是它们之间是氢键,这个键长设置的在这里就不合理了...

氢键在这里显示不出来,build   create H-bonds 然后给出氢键键长和键角(lst文件里面有),选择给体和受体添加氢键
以大多数人的努力程度,还轮不到去拼天赋的地步
4楼2014-08-21 16:40:39
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