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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » DNA重组 » 关于in-fusion PCR问题
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andyzhengwp

金虫 (小有名气)

[求助] 关于in-fusion PCR问题 已有4人参与

我现在要将一个片段无缝的插入到一个质粒的特定位点中，Clontech的In-Fusion试剂盒已经买了，但是发现它需要将质粒线性化，如果酶切线性化的话将不是无缝连接，会有几个碱基多出来，质粒有太大无法pcr方法线性化。
求助：1，有没有好的方法师质粒不加碱基线性化（酶切之后再PCR，肯定会在以前质粒的基础上多出几个碱基来的）？
         2.或者有什么好的方法直接实现将一个片段无缝的插入到一个质粒的特定位点中？
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1楼 2014-08-19 10:53:45
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andyzhengwp

金虫 (小有名气)
引用回帖:
17楼: Originally posted by ksws0465326 at 2014-08-21 08:26:06
我的实验是这样的，一共设计两对引物，载体一对（R1－F1），目的基因一对（F2-R2），目的：将目的基因插入载体中。我将每条引物分为A，B两段，用GXL分别扩增载体和目的基因。其中，R1A为基因插入前段载体序列，R1B ...

我用的您推荐的条件，primerSTAR MAX，50ul体系，50度退火，68度延伸7min，质粒没有做过单酶切。
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18楼2014-08-21 10:21:49
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bio_sci

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2014-08-19 12:46:28
andyzhengwp: 金币+10, ★★★很有帮助 2014-08-19 14:56:28
酶切线性化，然后用Klenow酶大片段 补平，不过引物设计的时候得注意了
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2楼2014-08-19 12:40:35
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ksws0465326

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
andyzhengwp: 金币+5 2014-08-19 14:56:35
andyzhengwp: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-08-19 14:56:46
不知道你用的质粒到底多大，我前些时曾经扩增4k＋的线性质粒，用的primerstar GXL，效果很好，而且用这个扩增，线性DNA末尾不会像Taq那样多出一个A碱基。如果可以的话你可以拿这个试一试扩增你的质粒。
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3楼2014-08-19 13:32:12
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andyzhengwp

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by ksws0465326 at 2014-08-19 13:32:12
不知道你用的质粒到底多大，我前些时曾经扩增4k＋的线性质粒，用的primerstar GXL，效果很好，而且用这个扩增，线性DNA末尾不会像Taq那样多出一个A碱基。如果可以的话你可以拿这个试一试扩增你的质粒。

我的质粒有7k多，我用的primerstar MAX酶，结果没有扩出来
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4楼2014-08-19 14:52:12
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