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sunmuer

木虫 (小有名气)

[交流] 【讨论】关于如何建立晶体结构的讨论

这个讨论是我求助的一个整理帖子。
我求助内容为如何建立PbWO4晶体的模型。
步骤:
build/build crystal,弹出对话框
然后按照晶格参数填入。这个时候要选择空间群(group这个选项)
这里注意,在开始建立的时候要填入的是晶格参数,也就是a,b,c;
然后添加原子,添加原子的时候要填入的是每个元素对应的坐标,也就是x,y,z
进行到这里,初步的结构就出来了。
然后要点build/crystal/rebuild crystal;这样,图形就整洁了很多。
按照教程所说,还要点build/symmetry/primitive cell

注意事项:
已经知道其晶格参数(这点重要啊,开始不了解需要知道这个参数,走了一些弯路)。
开始构建的时候犯了个错误,在add atom的时候没有注意弹出的对话框里有个Option选项,里面有个坐标要选分数坐标。所以,这里也要注意下。

最后,谢谢各位的帮忙。另外,如果有什么问题,请指正!

[ Last edited by wuli8 on 2009-6-13 at 17:24 ]
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出清水而不染
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hopingzmn

金虫 (知名作家)

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢指点
大体上是这样的,还有一种方法就是导入结构基本相同的进行修改

另外不一定要点build/symmetry/primitive cell,有时候可能是灰色的不能点,primitive cell最大的用处就是渐少计算时间。

我一直期待有高手来指导各种体系的建模经验
淡定
2楼2008-04-11 11:38:55
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aylayl08

荣誉版主 (文坛精英)

至尊天蝎

优秀版主

★ ★
suntao1982(金币+2,VIP+0):谢谢,欢迎常来计算模拟版!
你的构建的晶胞不是primitive,才能够转换成primitivecell;还有我记得在输入小数坐标时默认的就是fractional(小数坐标、分数坐标)。
建议你应该在这个版块上多看看相关帖子,已经有很多这样的讨论了,也好节省时间。
珍惜拥有,快乐人生!欢迎光临计算模拟区(*^__^*)。。。。。。。。。。。。。。
3楼2008-04-11 14:15:46
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sunmuer

木虫 (小有名气)

我总是在这个板块出没的,不过详细的过程探讨看到不是很多啊。特别是对新手来说,有的时候还是详细说明较好。
出清水而不染
4楼2008-04-12 06:40:14
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SHY31

至尊木虫 (知名作家)

小木虫研究生院西南地区区长

优秀版主

★ ★
小红豆(金币+2,VIP+0):3X!
我一般用这个build/symmetry/supercell

选择2x2x2根据不同的要求可以做元素掺杂
小木虫研究生院
5楼2008-04-12 09:07:55
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cuihang

铁杆木虫 (正式写手)

VASPer

和大家分享我的量化老师说过的一句话:
把结构输入到计算机里是一种高超的艺术
聪明人知道自己是傻子,傻子以为自己是聪明人
6楼2008-04-12 09:27:58
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sunmuer

木虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by SHY31 at 2008-4-12 09:07:
我一般用这个build/symmetry/supercell

选择2x2x2根据不同的要求可以做元素掺杂

可以详细点说说么?
出清水而不染
7楼2008-04-13 08:35:11
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wuli8

荣誉版主 (知名作家)

…………

优秀版主优秀版主


suntao1982(金币+1,VIP+0):谢谢,欢迎常来计算模拟版!
引用回帖:
Originally posted by sunmuer at 2008-4-13 08:35:


可以详细点说说么?

建立好超元胞后就可以替换你想要替换的原子了。
…………
8楼2008-04-13 13:43:34
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墨香

银虫 (正式写手)

然后添加原子,添加原子的时候要填入的是每个元素对应的坐标,也就是x,y,z

按文献给的数据输入之后出现
unable to add atoms failed to the determine position constraint
consider reducing the tolerance used for the atom proximity test

在display style 里面把原子尺寸调到最小也不行,,弱弱得问一句把options里面得warn if atoms closer than 1A,不选择可以加入,但这样模拟得结果会不会出错啊
于千万人之中,遇见你所遇见的人,于千万年之中,时间无涯的荒野里,没有早一步,也没晚一步,刚巧赶上了……
9楼2008-06-08 16:14:59
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spur

金虫 (正式写手)

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢
要尊重事实,如果两个原子之间的距离都小于1angstrom,这是什么概念呢?你再检查坐标输入是否正确,文献给的原子的坐标是否正确,多找两篇文献查一下,有可能是你现在看到的文献的参数给得有问题。
10楼2008-06-09 09:08:40
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