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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » 【讨论】关于如何建立晶体结构的讨论
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墨香

银虫 (正式写手)
做这个物质的人不多，文章都是一个课题组发的，原子数据都一样。有篇还是science上的，应该没问题吧。但是你说的也有道理。

各位大侠有没有什么好的解决方法的？难道的自己做单晶去测吗？？
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于千万人之中，遇见你所遇见的人，于千万年之中，时间无涯的荒野里，没有早一步，也没晚一步，刚巧赶上了……
11楼2008-06-11 18:01:21
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墨香

银虫 (正式写手)
★ ★ ★
zzgyb(金币+3,VIP+0):谢谢你的参与，化学区正在举办十大“耐思”版主评选，http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=845527，欢迎你去投票支持计模版版主！
附上文献中的数据，有兴趣的可以看看
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12楼2008-06-11 18:51:49
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multiscale

铁虫 (初入文坛)
if the miller index is (0001), for example, alpha-Al2O3(0001), how to  convert  it to three-parameter (u,v,w) crystal plane and get the right u,v,w as input in surface cleave?  Thanks!

[ Last edited by multiscale on 2008-6-17 at 04:44 ]
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13楼2008-06-17 04:40:48
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墨香

银虫 (正式写手)
材料科学的书上有公式
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14楼2008-06-17 20:52:32
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acridine

木虫 (正式写手)
★ ★
spur(金币+2,VIP+0):3Q!感谢参与！
引用回帖:
Originally posted by 墨香 at 2008-6-8 16:14:
然后添加原子，添加原子的时候要填入的是每个元素对应的坐标，也就是x,y,z

按文献给的数据输入之后出现
unable to add atoms failed to the determine position constraint
consider reducing the tolerance ...

warn if atoms closer than 1A，不选择可以加入，
那么加入之后有没有看一看这两个原子间距是多少呢? 如果真的是距离小于1A,那么有可能是提供的坐标出了问题,还有一种可能是在添加时由于某些原因重复添加了原子.导致两个原子出现在同一个位置
把原子坐标贴出来大家讨论一下吧
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15楼2008-06-17 21:24:45
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aylayl08

荣誉版主 (文坛精英)

至尊天蝎

优秀版主
引用回帖:
Originally posted by acridine at 2008-6-17 21:24:

warn if atoms closer than 1A，不选择可以加入，
那么加入之后有没有看一看这两个原子间距是多少呢? 如果真的是距离小于1A,那么有可能是提供的坐标出了问题,还有一种可能是在添加时由于某些原因重复添加了原子 ...

有道理
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珍惜拥有，快乐人生!欢迎光临计算模拟区(*^__^*)。。。。。。。。。。。。。。
16楼2008-06-17 21:30:49
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墨香

银虫 (正式写手)
附件里面的数据就是，有兴趣的看看，可能是我哪儿弄错了
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17楼2008-06-18 09:04:00
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anvier

木虫 (正式写手)
lei0736(金币+0,VIP+0):都是约化坐标 要乘以晶格常数的
引用回帖:
Originally posted by acridine at 2008-6-17 21:24:

warn if atoms closer than 1A，不选择可以加入，
那么加入之后有没有看一看这两个原子间距是多少呢? 如果真的是距离小于1A,那么有可能是提供的坐标出了问题,还有一种可能是在添加时由于某些原因重复添加了原子 ...

ICSD上好多金属化合物的结构数据都是这样的啊，不是会数据出错的。
我也需要到这个问题了，怎么解决呢？

数据如下：

Unit Cell 9.234(5) 9.234(5) 9.234(5) 90. 90. 90.
SG Number 217

Atom # OX SITE x y z SOF H ITF(B)
V 1 +0 8 c 0.1062(3) 0.1062(3) 0.1062(3) 0.5 0 0.52
V 2 +0 8 c 0.8300(3) 0.8300(3) 0.8300(3) 1. 0 0.3
V 3 +0 12 e 0 0 0.3522(42) 0.6667 0 0.53
Al 1 +0 8 c 0.1062(3) 0.1062(3) 0.1062(3) 0.5 0 0.52
Al 2 +0 12 e 0 0 0.3522(42) 0.3333 0 0.53
Al 3 +0 24 g 0.3087(3) 0.3087(3) 0.0394(3) 1. 0 0.63
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18楼2008-06-20 14:38:31
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acridine

木虫 (正式写手)
不太会看
V1, Al1 坐标一样？
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19楼2008-06-21 11:24:11
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spur

金虫 (正式写手)
★
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢
引用回帖:
Originally posted by multiscale at 2008-6-17 04:40:
if the miller index is (0001), for example, alpha-Al2O3(0001), how to  convert  it to three-parameter (u,v,w) crystal plane and get the right u,v,w as input in surface cleave?  Thanks!

[ Last e ...

对晶面指数从（hkil）转换成(hkl)只要去掉i即可；反之加上i=-(h+k)。
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20楼2008-06-21 14:21:42
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