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sunmuer

木虫 (小有名气)

[交流] 【讨论】关于如何建立晶体结构的讨论

这个讨论是我求助的一个整理帖子。
我求助内容为如何建立PbWO4晶体的模型。
步骤:
build/build crystal,弹出对话框
然后按照晶格参数填入。这个时候要选择空间群(group这个选项)
这里注意,在开始建立的时候要填入的是晶格参数,也就是a,b,c;
然后添加原子,添加原子的时候要填入的是每个元素对应的坐标,也就是x,y,z
进行到这里,初步的结构就出来了。
然后要点build/crystal/rebuild crystal;这样,图形就整洁了很多。
按照教程所说,还要点build/symmetry/primitive cell

注意事项:
已经知道其晶格参数(这点重要啊,开始不了解需要知道这个参数,走了一些弯路)。
开始构建的时候犯了个错误,在add atom的时候没有注意弹出的对话框里有个Option选项,里面有个坐标要选分数坐标。所以,这里也要注意下。

最后,谢谢各位的帮忙。另外,如果有什么问题,请指正!

[ Last edited by wuli8 on 2009-6-13 at 17:24 ]
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出清水而不染
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anvier

木虫 (正式写手)

lei0736(金币+0,VIP+0):都是约化坐标 要乘以晶格常数的
引用回帖:
Originally posted by acridine at 2008-6-17 21:24:

warn if atoms closer than 1A,不选择可以加入,
那么加入之后有没有看一看这两个原子间距是多少呢? 如果真的是距离小于1A,那么有可能是提供的坐标出了问题,还有一种可能是在添加时由于某些原因重复添加了原子 ...

ICSD上好多金属化合物的结构数据都是这样的啊,不是会数据出错的。
我也需要到这个问题了,怎么解决呢?

数据如下:

Unit Cell 9.234(5) 9.234(5) 9.234(5) 90. 90. 90.
SG Number 217

Atom # OX SITE x y z SOF H ITF(B)
V 1 +0 8 c 0.1062(3) 0.1062(3) 0.1062(3) 0.5 0 0.52
V 2 +0 8 c 0.8300(3) 0.8300(3) 0.8300(3) 1. 0 0.3
V 3 +0 12 e 0 0 0.3522(42) 0.6667 0 0.53
Al 1 +0 8 c 0.1062(3) 0.1062(3) 0.1062(3) 0.5 0 0.52
Al 2 +0 12 e 0 0 0.3522(42) 0.3333 0 0.53
Al 3 +0 24 g 0.3087(3) 0.3087(3) 0.0394(3) 1. 0 0.63
18楼2008-06-20 14:38:31
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hopingzmn

金虫 (知名作家)

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢指点
大体上是这样的,还有一种方法就是导入结构基本相同的进行修改

另外不一定要点build/symmetry/primitive cell,有时候可能是灰色的不能点,primitive cell最大的用处就是渐少计算时间。

我一直期待有高手来指导各种体系的建模经验
淡定
2楼2008-04-11 11:38:55
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aylayl08

荣誉版主 (文坛精英)

至尊天蝎

优秀版主

★ ★
suntao1982(金币+2,VIP+0):谢谢,欢迎常来计算模拟版!
你的构建的晶胞不是primitive,才能够转换成primitivecell;还有我记得在输入小数坐标时默认的就是fractional(小数坐标、分数坐标)。
建议你应该在这个版块上多看看相关帖子,已经有很多这样的讨论了,也好节省时间。
珍惜拥有,快乐人生!欢迎光临计算模拟区(*^__^*)。。。。。。。。。。。。。。
3楼2008-04-11 14:15:46
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sunmuer

木虫 (小有名气)

我总是在这个板块出没的,不过详细的过程探讨看到不是很多啊。特别是对新手来说,有的时候还是详细说明较好。
出清水而不染
4楼2008-04-12 06:40:14
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