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相对单位与绝对单位的定义
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我们在circos.conf文件中定义有chromosomes_units = 1000000,它才会以Mb为单位显示。在circos的绘图单位中,有一个u单位,这个u就是指的chromosomes_units了。如果你将chromosomes_units设置成10M,那么上面的语句就需要改成hs1:0-10…这样子。 我们前面已经了解到了一些,在ideogram.conf文件中<spacing>…</spacing>就是用于设置间隔的,也了解到什么是u单位。在circos中,除了u单位,还有一个r单位。r是 relative的首字母,它是指相对于全图的大小。比如本文中使用的deault = 0.005r就是使用的r单位。我们可以将u视作绝对单位,把r视作相对单位。 文献来自于《circos系列教程合集》 我在网上搜过,但是还是不太明白。我个人观点是把它理解成了相对值和定值。个人理解的估计有偏差。希望各位大神能用自己的语言帮我解释下。 |
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