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xgyun1018

银虫 (小有名气)

[交流] 求助 转基因鉴定实验

各位大虾,我成功将基因利用农杆菌浸染方法转化进拟南芥,但是在T0代鉴定阳性植株的时候出现了问题,特地各位请教。大致情况是这样的。

我将所提取的RNA反转录得到cDNA,同时做了一个对照,两管唯一的区别就是对照的管中未加反转录酶。我分别利用这两管做模板进行PCR扩增(引物为克隆目的基因时所用引物),结果两个均可以扩增出目的基因大小的条带,并且对照那管的条带亮度比cDNA做模板的条带要亮,我重复了3次均是这样。一直未找到合理的解释。

今天我又将对照的那管补加上反转录酶,并且75度10分钟,然后做模板进行PCR,结果跟以前的一样,还是比cDNA做模板亮!人快疯了!

希望大哥大姐们多多指点小弟啊,谢谢谢谢

[ Last edited by 350784478 on 2009-7-12 at 09:21 ]
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叶子sunny

新虫 (初入文坛)

和我遇到的问题类似,不知道你现在找到解决方案了没??
2楼2008-08-23 17:34:53
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snow889

提取的RNA又没有经过DNA酶的处理?我觉得你的RNA样品可能污染了DNA。
3楼2008-08-24 00:38:10
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gaowei706

铁杆木虫 (职业作家)

资深潜水者

你转的是什么基因?是拟南芥本身的吗?你的提RNa用的什么方法?你的PCR体系是不是污染了?
逐渐失去棱角
4楼2008-08-24 10:21:31
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gaowei706

铁杆木虫 (职业作家)

资深潜水者

你用什么作的对照也没说清楚
逐渐失去棱角
5楼2008-08-24 10:22:23
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bioxy

木虫 (初入文坛)

我也觉得DNA污染的可能性比较大,用DNase I处理一下看看
6楼2008-08-26 15:35:32
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snzydong

铁杆木虫 (著名写手)

明显是DNA污染 有基因组DNA的存在
7楼2008-08-27 11:48:09
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lipishun

金虫 (小有名气)

★ ★
xyklmu(金币+2,VIP+0):感谢答复
DNA污染的可能性比较大,应该用个没有转基因的植株做对照!
你是看转基因的表达情况吗?
如果不是直接用总DNA或者SOUTHERN 都可以鉴定阳性植株的! 为什么要反转呢?
8楼2008-08-27 20:48:05
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xipha

木虫 (正式写手)

★ ★
xyklmu(金币+2,VIP+0):感谢答复
你的这段基因可能正好没有内含子,所以cDNA和DNA序列一致,用引物扩增得到相同条带,而由于DNA没有去干净,所以扩得出来,至于亮度问题,很可能是由于提取的RNA没有混匀,碰巧对照管中的基因量比较大。
9楼2008-08-31 16:51:14
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