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ChIP菜鸟,请问大神们阴性抗体Ig G(兔和鼠)怎么选,你们都是哪家公司的?
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zmlustc
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ChIP菜鸟,请问大神们阴性抗体Ig G(兔和鼠)怎么选,你们都是哪家公司的?
已有1人参与
本实验室的santa的Ig G浓度低,而且试过背景有点高。求指点推荐你们觉得使用效果不错的适合做ChIP鼠和兔的Ig G呀!
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2014-08-04 10:30:27
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2014-08-04 14:14:51
IgG control的选择取决于你所用于ChIP抗体的来源,如ChIP时用的兔(多抗)则只能选用normal rabbit IgG做对照,而且用量要一样。Santa Cruz的各种属normal IgG我都用过,应该可用。另外,你的背景有点高是什么含义?是PCR产物吗?若如此,一般不是抗体的问题,更可能是sonication的问题。
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2楼
2014-08-04 11:15:38
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2楼
:
Originally posted by
ssssllllnnnn
at 2014-08-04 11:15:38
IgG control的选择取决于你所用于ChIP抗体的来源,如ChIP时用的兔(多抗)则只能选用normal rabbit IgG做对照,而且用量要一样。Santa Cruz的各种属normal IgG我都用过,应该可用。另外,你的背景有点高是什么含义? ...
确实是荧光定量PCR的产物很高,如你所说可能是sonication的问题,但是我每次超声的片段跑DNA胶确实是500bp左右,挺合适的呀!
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3楼
2014-08-04 19:01:45
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3楼
:
Originally posted by
zmlustc
at 2014-08-04 06:01:45
确实是荧光定量PCR的产物很高,如你所说可能是sonication的问题,但是我每次超声的片段跑DNA胶确实是500bp左右,挺合适的呀!...
可尝试:
1)IP的时候洗的彻底一些、抗体及细胞裂解液用量少些。
2)先用normal IgG pre-clear一下,然后再按正常步骤进行IP。
其实:
如果IgG control和目的蛋白的抗体间IP后PCR有明显差异,则问题不大,只要调整PCR循环数就可以降低IgG control的水平。另外如果这个差别存在,也可以用QPCR进行定量。
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4楼
2014-08-04 21:06:28
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4楼
:
Originally posted by
ssssllllnnnn
at 2014-08-04 21:06:28
可尝试:
1)IP的时候洗的彻底一些、抗体及细胞裂解液用量少些。
2)先用normal IgG pre-clear一下,然后再按正常步骤进行IP。
其实:
如果IgG control和目的蛋白的抗体间IP后PCR有明显差异,则问题不大,只 ...
我做的就是QPCR,Ig G control和目的蛋白抗体间没有明显差别,反而还略高,倒是阳性抗体很高,比他们俩高很多。
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5楼
2014-08-05 09:05:05
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:
Originally posted by
zmlustc
at 2014-08-05 09:05:05
我做的就是QPCR,Ig G control和目的蛋白抗体间没有明显差别,反而还略高,倒是阳性抗体很高,比他们俩高很多。
...
你好,你的chip做的就是QPCR,Ig G control和目的蛋白抗体间没有明显差别,反而还略高,的问题解决了吗?我也遇到了,想不明白,求大神指点!
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6楼
2015-10-29 15:29:40
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zmlustc
at 2014-08-04 19:01:45
确实是荧光定量PCR的产物很高,如你所说可能是sonication的问题,但是我每次超声的片段跑DNA胶确实是500bp左右,挺合适的呀!...
你好,打扰一下,你的这个问题确实是荧光定量PCR的产物很高,如你所说可能是sonication的问题,但是我每次超声的片段跑DNA胶确实是500bp左右,挺合适的呀我也遇到同样的问题,求大神指点。
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7楼
2015-10-29 15:31:38
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