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zmlustc

铁虫 (初入文坛)

[求助] ChIP菜鸟,请问大神们阴性抗体Ig G(兔和鼠)怎么选,你们都是哪家公司的? 已有1人参与

本实验室的santa的Ig G浓度低,而且试过背景有点高。求指点推荐你们觉得使用效果不错的适合做ChIP鼠和兔的Ig G呀!
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ssssllllnnnn

至尊木虫 (知名作家)

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引用回帖:
3楼: Originally posted by zmlustc at 2014-08-04 06:01:45
确实是荧光定量PCR的产物很高,如你所说可能是sonication的问题,但是我每次超声的片段跑DNA胶确实是500bp左右,挺合适的呀!...

可尝试:
1)IP的时候洗的彻底一些、抗体及细胞裂解液用量少些。
2)先用normal IgG pre-clear一下,然后再按正常步骤进行IP。

其实:
如果IgG control和目的蛋白的抗体间IP后PCR有明显差异,则问题不大,只要调整PCR循环数就可以降低IgG control的水平。另外如果这个差别存在,也可以用QPCR进行定量。
4楼2014-08-04 21:06:28
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ssssllllnnnn

至尊木虫 (知名作家)

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【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+3, 鼓励回帖交流! 2014-08-04 14:14:51
IgG control的选择取决于你所用于ChIP抗体的来源,如ChIP时用的兔(多抗)则只能选用normal rabbit IgG做对照,而且用量要一样。Santa Cruz的各种属normal IgG我都用过,应该可用。另外,你的背景有点高是什么含义?是PCR产物吗?若如此,一般不是抗体的问题,更可能是sonication的问题。
2楼2014-08-04 11:15:38
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zmlustc

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by ssssllllnnnn at 2014-08-04 11:15:38
IgG control的选择取决于你所用于ChIP抗体的来源,如ChIP时用的兔(多抗)则只能选用normal rabbit IgG做对照,而且用量要一样。Santa Cruz的各种属normal IgG我都用过,应该可用。另外,你的背景有点高是什么含义? ...

确实是荧光定量PCR的产物很高,如你所说可能是sonication的问题,但是我每次超声的片段跑DNA胶确实是500bp左右,挺合适的呀!
3楼2014-08-04 19:01:45
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zmlustc

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by ssssllllnnnn at 2014-08-04 21:06:28
可尝试:
1)IP的时候洗的彻底一些、抗体及细胞裂解液用量少些。
2)先用normal IgG pre-clear一下,然后再按正常步骤进行IP。

其实:
如果IgG control和目的蛋白的抗体间IP后PCR有明显差异,则问题不大,只 ...

我做的就是QPCR,Ig G control和目的蛋白抗体间没有明显差别,反而还略高,倒是阳性抗体很高,比他们俩高很多。
5楼2014-08-05 09:05:05
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