24小时热门版块排行榜    

查看: 1187  |  回复: 5
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

Hector_BioQ

银虫 (初入文坛)

[求助] 请教iTRAQ和Label Free的蛋白定量相关问题 已有1人参与

请问下版上的质谱高手,小弟的问题是这样的:
共有7个蛋白混合样品,其中一个是对照组,需要得到的信息是:1.每个样品中蛋白的种类;2.每个样品中所含蛋白的丰度;3.各组样品间相同蛋白的含量的相对差异。
目前知道的是iTRAQ和Label Free都是可以做到第一条和第三条的。但是咨询了国内的一些公司,大多数都不能实现第二条,但是文献里使用Label Free的技术(引入内参)是可以对同一样品中各类蛋白的丰度做出定量分析的。公司给的答复是国内技术水品不能够实现。请问真的是这样的么?另外,通过对同一样品里不同蛋白肽段数的分析不能够获得各自的丰度信息么?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

biotpack2

捐助贵宾 (小有名气)


定量蛋白组是相对定量,是用肽段对应峰面积的积分值作为相对定量的指标。所以第1和3都是长队的定量蛋白组内容。你说的加入一个内参,然后进行蛋白丰度的定量,只能说理论上是没问题的,但是实际做起来不确定会有哪些问题。欢迎来百泰派克生物科技咨询,我们有信心能够提供帮助
6楼2020-06-23 15:37:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

馒头爱生物

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

你这个“每个样品中所含蛋白的丰度”指的是什么?是指这一个样品中含有的各种不同种类的蛋白的相对含量差异吗?
2楼2014-09-05 15:18:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

馒头爱生物

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

label free是不含内参的,含内参的就不叫做label free了。
引入内参的定量方法也不能满足你的要求,因为你没办法合成这样的内参。内参的方法只能对样品中一种或者几种蛋白进行绝对定量。
3楼2014-09-05 15:39:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

馒头爱生物

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
Hector_BioQ: 金币+50, ★★★很有帮助 2014-09-07 22:29:52
同一样品中不同肽段数也不代表样品的丰度
第一,肽段分为特异的和非特异的两种,非特异肽段在几种蛋白中都有,你不能确定它到底是哪一种蛋白的
第二,就算不存在第一点,肽段有长有短,质谱仪检测不同肽段的能力也有不同
4楼2014-09-05 15:41:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 国自然评审意见 +7 wangmingqi 2026-08-28 8/400 2026-08-28 18:42 by zhuzg0628
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +13 晴天加油 2026-08-26 14/700 2026-08-28 18:36 by huagongfeihu
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的? +16 爱看书的可乐 2026-08-26 18/900 2026-08-28 17:09 by winsaint
[教师之家] 导师吐槽:我怎么摊上了这么个极品研究生! +8 苏东坡二世 2026-08-23 8/400 2026-08-28 14:41 by lkforward
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +3 bud_bud 2026-08-27 6/300 2026-08-28 11:53 by bud_bud
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识 +5 yuleib84 2026-08-26 6/300 2026-08-28 00:02 by yudaoqian88
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 5/250 2026-08-27 20:50 by gdfollow
[基金申请] 申请删除本帖 +6 lyz123lyz 2026-08-27 7/350 2026-08-27 17:31 by 宁静致远sy
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +5 叶九微 2026-08-26 5/250 2026-08-27 10:35 by l_zh2008
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜? 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 国际合作可查了,中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 明天应该可查了!? +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
[基金申请] 某些机构,以效率低为荣,以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
信息提示
请填处理意见