24小时热门版块排行榜    

查看: 1208  |  回复: 5
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

Hector_BioQ

银虫 (初入文坛)

[求助] 请教iTRAQ和Label Free的蛋白定量相关问题 已有1人参与

请问下版上的质谱高手,小弟的问题是这样的:
共有7个蛋白混合样品,其中一个是对照组,需要得到的信息是:1.每个样品中蛋白的种类;2.每个样品中所含蛋白的丰度;3.各组样品间相同蛋白的含量的相对差异。
目前知道的是iTRAQ和Label Free都是可以做到第一条和第三条的。但是咨询了国内的一些公司,大多数都不能实现第二条,但是文献里使用Label Free的技术(引入内参)是可以对同一样品中各类蛋白的丰度做出定量分析的。公司给的答复是国内技术水品不能够实现。请问真的是这样的么?另外,通过对同一样品里不同蛋白肽段数的分析不能够获得各自的丰度信息么?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

biotpack2

捐助贵宾 (小有名气)


定量蛋白组是相对定量,是用肽段对应峰面积的积分值作为相对定量的指标。所以第1和3都是长队的定量蛋白组内容。你说的加入一个内参,然后进行蛋白丰度的定量,只能说理论上是没问题的,但是实际做起来不确定会有哪些问题。欢迎来百泰派克生物科技咨询,我们有信心能够提供帮助
6楼2020-06-23 15:37:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

馒头爱生物

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

你这个“每个样品中所含蛋白的丰度”指的是什么?是指这一个样品中含有的各种不同种类的蛋白的相对含量差异吗?
2楼2014-09-05 15:18:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

馒头爱生物

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

label free是不含内参的,含内参的就不叫做label free了。
引入内参的定量方法也不能满足你的要求,因为你没办法合成这样的内参。内参的方法只能对样品中一种或者几种蛋白进行绝对定量。
3楼2014-09-05 15:39:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

馒头爱生物

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
Hector_BioQ: 金币+50, ★★★很有帮助 2014-09-07 22:29:52
同一样品中不同肽段数也不代表样品的丰度
第一,肽段分为特异的和非特异的两种,非特异肽段在几种蛋白中都有,你不能确定它到底是哪一种蛋白的
第二,就算不存在第一点,肽段有长有短,质谱仪检测不同肽段的能力也有不同
4楼2014-09-05 15:41:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 要骂人了,新模版改版就是要淡化问题凝练这种虚的东西,结果有个评委还在说凝练得不够 +5 瞬息宇宙 2026-08-31 8/400 2026-09-02 09:37 by 昵称告罄
[基金申请] 科研人应该花精力去思考如何解决问题,而不是去凝练问题 +3 瞬息宇宙 2026-09-01 5/250 2026-09-02 08:01 by anjeeshine
[基金申请] 面上合作单位盖章 +6 ssyjh 2026-08-27 9/450 2026-09-01 20:01 by huagongfeihu
[基金申请] 面上函评意见出来了,像什么等级? 20+4 Tsingking1 2026-08-27 17/850 2026-09-01 19:51 by 超级无敌华子
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +5 bjdxyxy 2026-08-26 5/250 2026-09-01 17:54 by 小伟大博士
[基金申请] 学科评审组评审是指会评吗? +4 瞬息宇宙 2026-08-31 4/200 2026-09-01 14:58 by jiaoxg
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高,自己申请怎么就这么难 +13 Kittylucky 2026-08-27 14/700 2026-09-01 11:06 by feng6531
[论文投稿] 小白求助 投论文要求的highlights应该如何写 5+3 l1963982152 2026-08-29 4/200 2026-09-01 09:04 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见(F口面上) +7 gdd2018 2026-08-28 12/600 2026-09-01 08:32 by 尼古拉斯小虫
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +6 叶九微 2026-08-26 6/300 2026-08-31 23:54 by yudaoqian88
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +6 zhaosm1982 2026-08-27 7/350 2026-08-31 21:18 by qdxxmc
[基金申请] 哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识 +6 yuleib84 2026-08-26 7/350 2026-08-31 19:46 by 鱼翔浅底1
[基金申请] 面上意见出来了 +12 黄鸟于飞Chao 2026-08-29 23/1150 2026-08-31 18:57 by 黄鸟于飞Chao
[基金申请] 中青基了要发朋友圈吗? +7 349506619 2026-08-28 7/350 2026-08-31 13:39 by 冼亮淀粉酶
[基金申请] 29号明天会评吗 +4 笨笨唐 2026-08-28 4/200 2026-08-31 09:30 by huixian257
[基金申请] 为什么到现在没收到通知? +5 tannykie 2026-08-29 5/250 2026-08-30 21:05 by purplejack
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
信息提示
请填处理意见