24小时热门版块排行榜    

查看: 992  |  回复: 5
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

Hector_BioQ

银虫 (初入文坛)

[求助] 请教iTRAQ和Label Free的蛋白定量相关问题 已有1人参与

请问下版上的质谱高手,小弟的问题是这样的:
共有7个蛋白混合样品,其中一个是对照组,需要得到的信息是:1.每个样品中蛋白的种类;2.每个样品中所含蛋白的丰度;3.各组样品间相同蛋白的含量的相对差异。
目前知道的是iTRAQ和Label Free都是可以做到第一条和第三条的。但是咨询了国内的一些公司,大多数都不能实现第二条,但是文献里使用Label Free的技术(引入内参)是可以对同一样品中各类蛋白的丰度做出定量分析的。公司给的答复是国内技术水品不能够实现。请问真的是这样的么?另外,通过对同一样品里不同蛋白肽段数的分析不能够获得各自的丰度信息么?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

馒头爱生物

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

如果你实在是非要知道一个样品中不同蛋白的含量丰度,可以用HPLC对复杂样品进行初步分离,分成15-20个组分,降低样品复杂度
之后,利用液相质谱连用系统中蛋白的面积来粗略估算蛋白丰度

我也不是非常精通,如有不对的地方,请包涵,欢迎指正和讨论
5楼2014-09-05 15:44:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

馒头爱生物

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

你这个“每个样品中所含蛋白的丰度”指的是什么?是指这一个样品中含有的各种不同种类的蛋白的相对含量差异吗?
2楼2014-09-05 15:18:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

馒头爱生物

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

label free是不含内参的,含内参的就不叫做label free了。
引入内参的定量方法也不能满足你的要求,因为你没办法合成这样的内参。内参的方法只能对样品中一种或者几种蛋白进行绝对定量。
3楼2014-09-05 15:39:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

馒头爱生物

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
Hector_BioQ: 金币+50, ★★★很有帮助 2014-09-07 22:29:52
同一样品中不同肽段数也不代表样品的丰度
第一,肽段分为特异的和非特异的两种,非特异肽段在几种蛋白中都有,你不能确定它到底是哪一种蛋白的
第二,就算不存在第一点,肽段有长有短,质谱仪检测不同肽段的能力也有不同
4楼2014-09-05 15:41:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 291求调剂 +5 孅華 2026-03-22 5/250 2026-03-23 09:20 by haoshis
[考研] 一志愿中南大学化学学硕0703总分337求调剂 +4 niko- 2026-03-22 4/200 2026-03-23 07:56 by Iveryant
[考研] 一志愿北京化工大学 070300 学硕 336分 求调剂 +5 vv迷 2026-03-22 5/250 2026-03-23 07:36 by Iveryant
[考研] 280分求调剂 一志愿085802 +4 PUMPT 2026-03-22 7/350 2026-03-22 22:13 by 星空星月
[考研] 求调剂 +4 要好好无聊 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:57 by 学员8dgXkO
[考研] 0703化学297求调剂 +3 Daisy☆ 2026-03-20 3/150 2026-03-21 17:45 by ColorlessPI
[考研] 材料与化工(0856)304求 B区 调剂 +3 邱gl 2026-03-21 3/150 2026-03-21 13:47 by lature00
[考研] 265求调剂 +12 梁梁校校 2026-03-19 14/700 2026-03-21 13:38 by lature00
[考研] 机械专硕299求调剂至材料 +3 kkcoco25 2026-03-16 4/200 2026-03-21 03:52 by JourneyLucky
[考研] 265求调剂 +9 梁梁校校 2026-03-17 9/450 2026-03-21 02:17 by JourneyLucky
[考研] 22408 344分 求调剂 一志愿 华电计算机技术 +4 solanXXX 2026-03-20 4/200 2026-03-20 23:49 by alg094825
[考研] 材料与化工 322求调剂 +4 然11 2026-03-19 4/200 2026-03-20 22:12 by luoyongfeng
[考研] 一志愿南理工085701环境302求调剂院校 +3 葵梓卫队 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:28 by zhukairuo
[考研] 08工学调剂 +5 用户573181 2026-03-20 5/250 2026-03-20 15:47 by xia_2003
[考研] 0856调剂,是学校就去 +8 sllhht 2026-03-19 9/450 2026-03-20 14:25 by 无懈可击111
[考研] 320求调剂0856 +3 不想起名字112 2026-03-19 3/150 2026-03-19 22:53 by 学员8dgXkO
[考研] 286求调剂 +6 lemonzzn 2026-03-16 10/500 2026-03-19 14:31 by lemonzzn
[考研] 一志愿福大288有机化学,求调剂 +3 小木虫200408204 2026-03-18 3/150 2026-03-19 13:31 by houyaoxu
[考研] 【同济软件】软件(085405)考研求调剂 +3 2026eternal 2026-03-18 3/150 2026-03-18 19:09 by 搏击518
[考研] 一志愿南京大学,080500材料科学与工程,调剂 +4 Jy? 2026-03-16 4/200 2026-03-17 11:02 by gaoqiong
信息提示
请填处理意见