应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 新老版本gcc共存，如何设置让GROMACS调用新版gcc？
51/1返回列表
查看: 1718  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

xiaowandouer

木虫 (正式写手)

[求助] 新老版本gcc共存，如何设置让GROMACS调用新版gcc？ 已有3人参与

安装gromacs后，做了个能量最小化的例子测试软件是否安装成功。翻看能量最小化的log文件，发现初始部分关于编译器的信息还是老版本的，在.bashrc中已经给出了新版gcc  bin和lib的路径呀，为什么不能用呢？

备注：老版gcc是服务器管理员安装的，我没root权限，网上给的部分方法需要root权限。有没有不需要root就可以解决的方法？
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2014-07-29 11:57:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaowandouer

木虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by abdoman at 2014-07-30 08:50:55
你这个写错了哦，解析的顺序不对！
export LD_LIBRARY_PATH=安装路径/gcc4/lib：$LD_LIBRARY_PATH

先解析到你自己安装的。 PATH应该还好。 不放心的话，你gcc 编译时加-v 好像是显示版本号，看看就知道了。...

谢谢您的回复！
重新调整解析顺序，还是老样子。
如果重装gromacs，通过-DCMAKE_CXX_COMPILER和-DCMAKE_C_COMPILER指定gcc的版本是不是也可以？如果可以的话这样写对吗？
-DCMAKE_CXX_COMPILER=gcc安装路径/bin/g++
-DCMAKE_C_COMPILER=gcc安装路径/bin/gcc


另附gcc安装路径/bin/下的所有文件：
aot-compile    gcov           jcf-dump
c++            gij            jv-convert
cpp            gjar           rebuild-gcj-db
g++            gjarsigner     x86_64-unknown-linux-gnu-c++
gappletviewer  gjavah         x86_64-unknown-linux-gnu-g++
gc-analyze     gkeytool       x86_64-unknown-linux-gnu-gcc
gcc            gnative2ascii  x86_64-unknown-linux-gnu-gcc-4.8.3
gcc-ar         gorbd          x86_64-unknown-linux-gnu-gcc-ar
gcc-nm         grmic          x86_64-unknown-linux-gnu-gcc-nm
gcc-ranlib     grmid          x86_64-unknown-linux-gnu-gcc-ranlib
gcj            grmiregistry   x86_64-unknown-linux-gnu-gcj
gcj-dbtool     gserialver
gcjh           gtnameserv
赞一下 回复此楼
7楼2014-07-31 17:06:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

magicmonk

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
xiaowandouer(月只蓝代发): 金币+1, 鼓励交流！ 2014-07-30 16:51:32
设置一下环境变量
赞一下 回复此楼
我们最深的恐惧不是我们能力不够，我们最深的恐惧是能力超越了极限。
2楼2014-07-29 14:36:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaowandouer

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by magicmonk at 2014-07-29 14:36:37
设置一下环境变量

亲，能说的详细点么？我在.bashrc中已经给出了新版gcc  bin和lib的路径了呀，
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:安装路径/gcc4/lib：
export PATH=安装路径/gcc4/bin:${PATH}
是不是这么设置不对？
赞一下 回复此楼
3楼2014-07-29 17:02:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

老曼7

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
xiaowandouer(月只蓝代发): 金币+1, 鼓励交流！ 2014-07-30 16:51:37
Gromacs是你自己装的还是管理员装的？如果Gromacs不是你自己装的，那他运行时调用的可能就是全局的环境变量而不是用户自己的环境变量，建议你可以在自己的目录尝试编译安装一个并行版的，实验室的一个师姐就是这样子折腾的。

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
4楼2014-07-30 07:12:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 085801 总分275 本科新能源 求调剂 +8 bradoner 2026-04-08 9/450 2026-04-09 13:43 by only周
[考研] 一志愿华南师范大学0702物理学305调剂 +4 念常安 2026-04-07 6/300 2026-04-08 22:53 by bljnqdcc
[考研] 生物学328分求调剂 +9 闪电kkl 2026-04-08 10/500 2026-04-08 21:42 by liuhuiying09
[考研] 一志愿南昌大学，085600，344分求调剂 +11 调剂上岸玘 2026-04-05 12/600 2026-04-08 16:17 by luoyongfeng
[考研] 一志愿哈工大，初试329，求环境科学与工程调剂！ +11 余未辛 2026-04-06 11/550 2026-04-08 15:21 by screening
[考研] 273求调剂 +41 麦小叮当 2026-04-06 48/2400 2026-04-08 15:16 by screening
[考研] 求调剂 一志愿西南交通大学085701环境工程 282分 +15 多多爱吃汉堡 2026-04-04 16/800 2026-04-08 11:39 by i_cooler
[考研] 338求调剂 +8 wxygxsaaaaa 2026-04-06 8/400 2026-04-08 06:58 by 无际的草原
[考研] 331求调剂 +5 张元一 2026-04-07 6/300 2026-04-07 22:13 by hemengdong
[考研] 312求调剂 +18 gtw1 2026-04-06 20/1000 2026-04-07 18:16 by 蓝云思雨
[考研] 材料调剂 +11 一样YWY 2026-04-07 11/550 2026-04-07 15:13 by shdgaomin
[硕博家园] 0856材料化工求调剂，一志愿211，初试成绩349 +4 江淮北月 2026-04-05 4/200 2026-04-06 22:44 by chenzhimin
[考研] 071000生物学调剂 +7 拉提桃 2026-04-06 7/350 2026-04-06 18:55 by 52305043001
[考研] 材料调剂 +12 一样YWY 2026-04-04 12/600 2026-04-05 08:24 by 544594351
[考研] 338求调剂 +7 晟功? 2026-04-03 7/350 2026-04-04 20:37 by 蓝云思雨
[考研] 306求调剂 +3 hyb上名工 2026-04-02 3/150 2026-04-04 18:12 by 热情沙漠
[考研] 求生物学专业调剂-332分 +5 云朵遛弯指南 2026-04-04 5/250 2026-04-04 10:05 by rzh123456
[考研] 357求调剂 +13 1050389037 2026-04-03 13/650 2026-04-03 22:27 by 无际的草原
[考研] 考研调剂 +8 不爱喝饮料 2026-04-03 8/400 2026-04-03 16:40 by Mistake-J
[考研] 289-求调剂 +4 这里是_ 2026-04-03 4/200 2026-04-03 14:23 by 1753564080
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭