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MALDI-TOF-MS图谱分析 已有3人参与
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该结果是目标蛋白从胶上切下来后用trypsin处理后做MALDI-TOF-MS得到的结果，在http://www.matrixscience.com/cgi ... &SEARCH=PMF中检索没有结果，现在不会分析了，比如该蛋白分子量是多少，求给位帮帮忙，谢谢了。 MS.png |
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 蛋白质生物学实验经验 | 生物信息学 |
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袁1231
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2楼2014-08-13 22:13:36
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楼主这样明显把问题复杂化了，要是这样，你要用肽指纹图谱(PMF)进行搜索了，你完全可以直接不酶切做MALDI-TOF-MS，分子量就直接出来了。用要用肽指纹图谱(PMF)进行搜索实际上用于未知的蛋白质的鉴定，即从蛋白质数据库中找到与库中的同样的酶切片段的各个肽段的分子量信息与实验的蛋白质最为匹配的蛋白质是谁，然后鉴定出未知的蛋白质的身份信息。 我另外提供给楼主简单些的肽指纹图谱(PMF)为基础的未知蛋白质的身份确定的搜索方法。可以用：Mascot软件，从网上其搜索界面直接填好信息提交给Mascot，它自己就会完成搜索并给于你搜索的可能的匹配的蛋白质的信息。 Mascot软件的PMF提交界面就是：http://www.matrixscience.com/cgi ... &SEARCH=PMF ，楼主写对了，然后你按照界面的要求把信息填好提交就行了。可以参考：参见：薛庆中 等编著，DNA和蛋白质序列数据分析工具，科学出版社，2012，第三版，146-151，该书用的是http://www.matrixscience.com/cgi ... &SEARCH=MIS 提交界面，操作大同小异。 DNA和蛋白质序列数据分析工具_(第三版）下载：http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=7614763  Mascot网上提交界面(PMF).JPG |
3楼2014-08-13 23:35:29
wizardfan
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4楼2014-08-14 08:38:06
