应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 盒子边界处的bond、angle等怎么设置
111/2返回列表12下一页
查看: 1126  |  回复: 10
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

ysshj

金虫 (小有名气)

[交流] 盒子边界处的bond、angle等怎么设置 已有3人参与

盒子边界处的bond、angle等怎么设置

举个例子，如图。

Bonds
1 1 1 2
2 1 2 3
3 1 3 4
4 1 4 5
5 1 5 6

周期性边界的话，1、6之间怎么设置？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
一个人要像一支队伍。
1楼 2014-07-22 20:34:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Ballendtoo

银虫 (初入文坛)
前来学习
回复此楼
2楼2014-07-28 14:26:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ysshj

金虫 (小有名气)
人工置顶。
回复此楼
一个人要像一支队伍。
3楼2014-08-05 09:04:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ysshj

金虫 (小有名气)
UP,UP.
回复此楼
一个人要像一支队伍。
4楼2014-09-01 11:01:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

用户注销 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
本帖仅楼主可见
赞一下
5楼2014-09-03 17:56:18
已阅   申请模拟EPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

ysshj

金虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by liuzhu0706 at 2014-09-03 17:56:18
1和6不成键 不用设置啊 即使1运动出左边界后从右边界进入 也是和2键接的
猜你应该是想设置不直接键接的两个原子间的相互作用力吧 一般是用LJ potential

多谢！我是设想一个原子链，1和6应该跨边界成键，不知道怎么设置了。
赞一下 回复此楼
一个人要像一支队伍。
6楼2014-09-03 18:39:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

用户注销 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
本帖仅楼主可见
赞一下
7楼2014-09-03 19:11:05
已阅   申请模拟EPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

ysshj

金虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by liuzhu0706 at 2014-09-03 19:11:05
如果是你说这种环形分子而且跨边界成键 那岂不是没有周期性了...

一维的链，想象着是有周期性。不知道怎么设置。如果直接设1 6 成键（盒子内），就成环了，而且应该会报错。
1-2-3-4-5-6-1-2-3-4-5-6
赞一下 回复此楼
一个人要像一支队伍。
8楼2014-09-04 09:24:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

用户注销 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
本帖仅楼主可见
赞一下
9楼2014-09-04 19:31:23
已阅   申请模拟EPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

ysshj

金虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by liuzhu0706 at 2014-09-04 19:31:23
这个周期性跟周期性边界条件的周期性感觉不是一回事儿...

基本单元的重复，应该是一回事吧。只是不知道lammps里怎么定义6和镜像1的成键。
赞一下 回复此楼
一个人要像一支队伍。
10楼2014-09-04 20:56:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 ysshj 的主题更新
111/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭