应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 盒子边界处的bond、angle等怎么设置
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
111/2返回列表12下一页
查看: 1257  |  回复: 10
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

ysshj

金虫 (小有名气)

[交流] 盒子边界处的bond、angle等怎么设置 已有3人参与

盒子边界处的bond、angle等怎么设置

举个例子，如图。

Bonds
1 1 1 2
2 1 2 3
3 1 3 4
4 1 4 5
5 1 5 6

周期性边界的话，1、6之间怎么设置？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
一个人要像一支队伍。
1楼 2014-07-22 20:34:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Ballendtoo

银虫 (初入文坛)
前来学习
回复此楼
2楼2014-07-28 14:26:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ysshj

金虫 (小有名气)
人工置顶。
回复此楼
一个人要像一支队伍。
3楼2014-08-05 09:04:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ysshj

金虫 (小有名气)
UP,UP.
回复此楼
一个人要像一支队伍。
4楼2014-09-01 11:01:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

用户注销 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
本帖仅楼主可见
赞一下
5楼2014-09-03 17:56:18
已阅   申请模拟EPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

ysshj

金虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by liuzhu0706 at 2014-09-03 17:56:18
1和6不成键 不用设置啊 即使1运动出左边界后从右边界进入 也是和2键接的
猜你应该是想设置不直接键接的两个原子间的相互作用力吧 一般是用LJ potential

多谢！我是设想一个原子链，1和6应该跨边界成键，不知道怎么设置了。
赞一下 回复此楼
一个人要像一支队伍。
6楼2014-09-03 18:39:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

用户注销 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
本帖仅楼主可见
赞一下
7楼2014-09-03 19:11:05
已阅   申请模拟EPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

ysshj

金虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by liuzhu0706 at 2014-09-03 19:11:05
如果是你说这种环形分子而且跨边界成键 那岂不是没有周期性了...

一维的链，想象着是有周期性。不知道怎么设置。如果直接设1 6 成键（盒子内），就成环了，而且应该会报错。
1-2-3-4-5-6-1-2-3-4-5-6
赞一下 回复此楼
一个人要像一支队伍。
8楼2014-09-04 09:24:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

用户注销 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
本帖仅楼主可见
赞一下
9楼2014-09-04 19:31:23
已阅   申请模拟EPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

ysshj

金虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by liuzhu0706 at 2014-09-04 19:31:23
这个周期性跟周期性边界条件的周期性感觉不是一回事儿...

基本单元的重复，应该是一回事吧。只是不知道lammps里怎么定义6和镜像1的成键。
赞一下 回复此楼
一个人要像一支队伍。
10楼2014-09-04 20:56:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 ysshj 的主题更新
111/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 22408 266求调剂 +4 masss11222 2026-04-07 7/350 2026-04-08 01:37 by Linzejun
[考研] 327求调剂 +6 Xxjc1107. 2026-04-06 6/300 2026-04-08 00:27 by JourneyLucky
[考研] 求材料调剂，一志愿郑州大学289分 +16 硕星赴 2026-04-03 16/800 2026-04-07 20:23 by 云民大李老师
[考研] 301求调剂 +18 121. 2026-04-04 18/900 2026-04-07 17:49 by 蓝云思雨
[考研] 求调剂，一志愿厦门大学，生物与医药，总分272，本科211 +7 Electron1cc 2026-04-01 8/400 2026-04-07 16:06 by 可口可乐不加冰�
[考研] 材料求调剂 +18 一样YWY 2026-04-05 18/900 2026-04-07 15:49 by dxlg
[考研] 081700化学工程与技术 一志愿中海洋 323 求调剂学校 +19 披星河 2026-04-03 19/950 2026-04-07 15:14 by 尽舜尧1
[考研] 334分控制工程求调剂 +4 姜尚真sadasd 2026-04-03 4/200 2026-04-07 09:26 by 蓝云思雨
[考研] 285求调剂 +8 AZMK 2026-04-04 11/550 2026-04-06 13:56 by BruceLiu320
[考研] 一志愿C9的化学工程（085602） 340分，感觉校内调剂无望，求调剂 +12 万事宜臻 2026-04-04 12/600 2026-04-06 07:46 by 无际的草原
[考研] 化学0703-一志愿211-338分求调剂 +8 vants 2026-04-05 8/400 2026-04-06 06:17 by houyaoxu
[考研] 308求调剂 +3 终不似从前 2026-04-05 3/150 2026-04-05 22:23 by hemengdong
[考研] 考研调剂生寻找导师 +3 顾瞻考研啊 2026-04-05 3/150 2026-04-05 18:18 by 啵啵啵0119
[考研] 考研生物学考A区211，初试322，科目生化和生物综合，求调剂 +6 。。。54 2026-04-03 6/300 2026-04-05 14:54 by JOKER0401
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +4 崔wj 2026-04-04 5/250 2026-04-05 14:06 by imissbao
[考研] 083200 333求调剂 +3 十二！！ 2026-04-04 3/150 2026-04-05 08:28 by barlinike
[考研] 278求调剂 +14 范婷娜 2026-04-04 15/750 2026-04-04 22:15 by lqwchd
[考研] 生物学308分求调剂（一志愿华东师大） +7 相信必会光芒万� 2026-04-02 7/350 2026-04-03 16:48 by rzh123456
[考研] 调剂 +3 好好读书。 2026-04-01 6/300 2026-04-02 15:49 by liumengping
[考研] 282求调剂 +13 呼吸都是减肥 2026-04-01 13/650 2026-04-02 14:10 by baoball
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭