应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 盒子边界处的bond、angle等怎么设置
51/1返回列表
查看: 1210  |  回复: 10
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

ysshj

金虫 (小有名气)

[交流] 盒子边界处的bond、angle等怎么设置 已有3人参与

盒子边界处的bond、angle等怎么设置

举个例子，如图。

Bonds
1 1 1 2
2 1 2 3
3 1 3 4
4 1 4 5
5 1 5 6

周期性边界的话，1、6之间怎么设置？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
一个人要像一支队伍。
1楼 2014-07-22 20:34:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

用户注销 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
本帖仅楼主可见
赞一下
5楼2014-09-03 17:56:18
已阅   申请模拟EPI   回复此楼   编辑   查看我的主页
查看全部 11 个回答

ysshj

金虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by liuzhu0706 at 2014-09-03 17:56:18
1和6不成键 不用设置啊 即使1运动出左边界后从右边界进入 也是和2键接的
猜你应该是想设置不直接键接的两个原子间的相互作用力吧 一般是用LJ potential

多谢！我是设想一个原子链，1和6应该跨边界成键，不知道怎么设置了。
赞一下 回复此楼
一个人要像一支队伍。
6楼2014-09-03 18:39:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

用户注销 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
本帖仅楼主可见
赞一下
7楼2014-09-03 19:11:05
已阅   申请模拟EPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

ysshj

金虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by liuzhu0706 at 2014-09-03 19:11:05
如果是你说这种环形分子而且跨边界成键 那岂不是没有周期性了...

一维的链，想象着是有周期性。不知道怎么设置。如果直接设1 6 成键（盒子内），就成环了，而且应该会报错。
1-2-3-4-5-6-1-2-3-4-5-6
赞一下 回复此楼
一个人要像一支队伍。
8楼2014-09-04 09:24:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求材料调剂 +8 隔壁陈先生 2026-03-12 8/400 2026-03-18 22:19 by li123456789.
[考研] 330求调剂 +3 小材化本科 2026-03-18 3/150 2026-03-18 21:55 by 无懈可击111
[考研] 328求调剂，英语六级551，有科研经历 +3 生物工程调剂 2026-03-16 10/500 2026-03-18 20:41 by Wangjingyue
[考研] 一志愿中国海洋大学，生物学，301分，求调剂 +4 1孙悟空 2026-03-17 4/200 2026-03-18 17:59 by fivewind
[考研] 26调剂/材料/英一数二/总分289/已过A区线 +7 步川酷紫123 2026-03-13 7/350 2026-03-18 17:12 by 尽舜尧1
[考研] 311求调剂 +6 26研0 2026-03-15 6/300 2026-03-18 14:43 by haxia
[考研] 297求调剂 +8 戏精丹丹丹 2026-03-17 8/400 2026-03-18 14:30 by laoshidan
[考研] 070300化学319求调剂 +6 锦鲤0909 2026-03-17 6/300 2026-03-18 13:22 by Iveryant
[考博] 环境领域全国重点实验室招收博士1-2名 +3 QGZDSYS 2026-03-13 5/250 2026-03-18 11:13 by QGZDSYS
[考研] 生物学071000 329分求调剂 +3 我爱生物生物爱� 2026-03-17 3/150 2026-03-18 10:12 by macy2011
[考研] 265求调剂 +3 梁梁校校 2026-03-17 3/150 2026-03-18 09:12 by zhukairuo
[考研] 材料与化工专硕调剂 +5 heming3743 2026-03-16 5/250 2026-03-17 14:03 by 勇敢太监王公公
[考研] 一志愿南京大学，080500材料科学与工程，调剂 +4 Jy? 2026-03-16 4/200 2026-03-17 11:02 by gaoqiong
[考研] 285化工学硕求调剂（081700） +9 柴郡猫_ 2026-03-12 9/450 2026-03-17 10:18 by Sammy2
[考研] 26考研一志愿中国石油大学(华东)305分求调剂 +3 嘉年新程 2026-03-15 3/150 2026-03-15 13:58 by 哈哈哈哈嘿嘿嘿
[考研] 085601材料工程315分求调剂 +3 yang_0104 2026-03-15 3/150 2026-03-15 10:58 by peike
[考研] 材料工程调剂 +9 咪咪空空 2026-03-12 9/450 2026-03-13 22:05 by 星空星月
[考研] 求调剂 +5 一定有学上- 2026-03-12 5/250 2026-03-13 18:31 by ms629
[考研] 295求调剂 +3 小匕仔汁 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:17 by vgtyfty
[考研] 274求调剂 +3 S.H1 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:15 by JourneyLucky
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭