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fsy3224502

金虫 (小有名气)

[求助] 请各位大牛看下整个过程哪有问题?同源重组基因敲除 已有1人参与

小2最近一直做同源重组基因敲除,快半年了吧,一直卡在重组质粒注入宿主菌那一步!希望各位大人指点下,万分感谢,下面详细说一下:
宿主菌:巴氏杆菌
质粒:pWSK29(低拷贝质粒,有文献报道)
待敲除的目的基因大概1000bp左右,然后设计了2对上下游引物,各900bp,1200bp。重组载体构建比较顺利,分别插入上游,下游,抗性基因(四环素),大概1周时间。接下来是感受态的制备:
于新鲜平板上挑斑于5ml试管中,培养12-16小时,第二天取2ml接种到100锥形瓶中培养至OD600=0.5,按100U/ml加入透明质酸酶,继续培养1小时。
    (1) 将菌液于冰上预冷 15min,将菌液分装到预的 50 mL 离心管中,4℃,8000 r/min,离心 10 min,弃上清;
    (2) 用灭菌预冷的 10%的甘油(milli-Q超纯水)洗涤菌体 2 次,4℃,10000 r/min,离心 10 min,弃上清;
    (3) 加入 1.5 mL~2 mL 灭菌预冷的 10%的甘油重悬菌体,然后按 50 μL/管分装于灭菌预冷的 1.5ml 离心管中,-70℃冰箱中保存。
接下来是电转:
    (1) 将 5 μL(150ng) 重组质粒 与  感受态细胞混匀,转至 0.1 cm 冰浴冷的电转化杯中;
    (2) 设置电转仪参数:电压 2.5 KV/cm,5ms,将电转化杯外面的水擦干后进行电击,电击完毕后,加入液体培养基将菌体混匀,转至1.5 mL 的 EP 管中;
    (3) 37℃预热后转移至 200 r/min 摇床培养活化 2~3 h,使细菌复壮;
    (4) 将菌体悬液涂布于含有 四环素R (2.5μg/mL)抗性的平板上,每 200 μL 涂布一块平板;
    (5) 将平板置于 37℃恒温培养箱直至液体完全吸收,倒置平板,培养 36~48 h 后观察结果。
制备的感受态经过验证是没有污染的,在电击之后涂布带无抗性的平板上均能生长。但是一旦涂布含抗性的平板上就一个都不长。然后我又想是不是电击参数不对,然后又设置了几个参数:1.6,1.8,2.0,2.2,2.4,2.5kv,电击后涂布还是没有生长。总结出几个问题:
   (1)巴氏杆菌感受态的效率本来就低(文献报道),怎么能制备高效的感受态?
   (2)同源重组是不是由于概率低,需要在同一个电击条件下大量转化,才能得到较少的阳性菌株(大肠杆菌例外)?
   (3)由于巴氏杆菌荚膜的关系,很难离心,所以加入透明质酸酶,但是还是难以附着到离心管壁,特别在离心第三次的时候10000r/min也有少量菌体悬浮在液体中,只能用枪头慢慢选取上清,有没有一种方法能解决这问题?
   (4)最想问的就是,同源重组的概率到底有多大?是不是只有通过大量转化才能得到缺失株?


希望各位大人能细心看完上面的过程,指点下!万分感谢
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LIN琳LIN

新虫 (初入文坛)

我也在做同样的实验,不过我是革兰氏阳性菌,请问您的实验问题解决了吗?可否分享一下经验?
4楼2016-08-02 16:01:46
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鱼虾水中游

新虫 (初入文坛)

你好,请问后来你的问题解决了嘛?我现在也遇到了类似的问题,做电转都半年多了,感觉快崩溃了!急需帮助,谢谢!
梦想在心中,更在脚下!
2楼2016-04-28 16:59:41
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LIN琳LIN

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 鱼虾水中游 at 2016-04-28 16:59:41
你好,请问后来你的问题解决了嘛?我现在也遇到了类似的问题,做电转都半年多了,感觉快崩溃了!急需帮助,谢谢!

我也在做同样的实验,请问您的实验问题解决了?可否分享一下经验呢!
3楼2016-08-02 15:59:45
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18240090216

新虫 (初入文坛)

我也在做同样的实验,卡在这快一年了,不过我是革兰氏阳性菌,请问您的实验问题解决了吗?可否分享一下经验?
5楼2018-01-18 10:12:47
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