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wonwin29

金虫 (小有名气)

[求助] 过表达目的蛋白,mRNA芯片检测发现HSP家族上调,是真实的吗? 已有2人参与

在293细胞里过表达目的蛋白,mRNA芯片检测发现HSP家族显著上调(20倍以上),
因为HSP家族是和压力应激密切相关的,怀疑结果的可靠性,真实的吗?
或者只是外源表达蛋白引起的细胞应激反应?
但过表达其他蛋白,引起HSP家族上调没有如此显著。
更不解的是, Westernblot 验证,HSP蛋白水平并没有变化
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wonwin29

金虫 (小有名气)

HSP mRNA 上调数十倍, 蛋白没变化! 我真是晕了!
2楼2014-07-02 11:06:05
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乐乐王

铁虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
2楼: Originally posted by wonwin29 at 2014-07-02 11:06:05
HSP mRNA 上调数十倍, 蛋白没变化! 我真是晕了!

是不是转录后水平的调控造成的
3楼2014-07-05 00:17:30
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bio-li

金虫 (小有名气)

商家已经主动声明此回帖可能含有宣传内容

小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
芯片结果是存在假阳性的,所以需要验证,以PCR验证结果为主吧
你不能解决问题,你就会成为问题
4楼2014-07-07 09:32:16
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wonwin29

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by bio-li at 2014-07-07 09:32:16
芯片结果是存在假阳性的,所以需要验证,以PCR验证结果为主吧

芯片上调数十倍的都是假阳性的话,那还能相信什么啊? PCR没有验证,因为蛋白都没变化,就算验证出来也没法解释。
5楼2014-07-07 15:15:01
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wonwin29

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 乐乐王 at 2014-07-05 00:17:30
是不是转录后水平的调控造成的...

你是说,转录后调控以维持蛋白水平不变?除非是他的降解增加了?
6楼2014-07-07 15:16:28
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乐乐王

铁虫 (小有名气)


西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-07-07 19:06:26
引用回帖:
6楼: Originally posted by wonwin29 at 2014-07-07 15:16:28
你是说,转录后调控以维持蛋白水平不变?除非是他的降解增加了?...

芯片是转录水平的数据,相当一部分的基因转录和翻译水平不一定一致,转录后水平的调控手段很多,现在我们不确定该基因是不是真的表达了,也就谈不上降解增加之说,你觉得呢
7楼2014-07-07 17:54:07
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wonwin29

金虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 乐乐王 at 2014-07-07 17:54:07
芯片是转录水平的数据,相当一部分的基因转录和翻译水平不一定一致,转录后水平的调控手段很多,现在我们不确定该基因是不是真的表达了,也就谈不上降解增加之说,你觉得呢...

就是芯片上 mRNA增加,根本没有任何意义啊?可能在翻译前已经被调控、修饰、降解掉了?
8楼2014-07-08 17:05:22
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