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小小鑫000

铁虫 (小有名气)

[求助] 会用vfin.pl这个脚本的高手进来! 已有1人参与

各位前辈,大家好:
最近在用vasp算过渡态时,遇到了vfin.pl 这个脚本,但我不知道它怎么用,当我在计算的当前目录下,运行这个命令时,它出现了error:no output directory given。 这的意思难道是说这个脚本不能在当前目录下运行?那它到底怎么运行?还望大牛们指导呀,不胜感激!
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好好研究,天天向上!
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张丽芙

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yuraining at 2014-07-01 19:36:16
vfin.pl 后面应该有一个目录名,这样这一次NEB计算产生的文件都会转移到这个新目录里,原来的00-0n目录里面的就只有新的POSCAR文件了,可以进一步作为NEB计算的输入文件

请问后边这个output directory怎么写呢?
5楼2016-01-18 22:09:00
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yuraining

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小小鑫000: 金币+5 2014-07-02 11:32:03
vfin.pl 后面应该有一个目录名,这样这一次NEB计算产生的文件都会转移到这个新目录里,原来的00-0n目录里面的就只有新的POSCAR文件了,可以进一步作为NEB计算的输入文件
2楼2014-07-01 19:36:16
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小小鑫000

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yuraining at 2014-07-01 19:36:16
vfin.pl 后面应该有一个目录名,这样这一次NEB计算产生的文件都会转移到这个新目录里,原来的00-0n目录里面的就只有新的POSCAR文件了,可以进一步作为NEB计算的输入文件

前辈,谢谢您的指导,那我是不是可以在第一遍粗算过渡态后,只用一下这个命令,别的什么都不用管,来进行下一步精算了?
好好研究,天天向上!
3楼2014-07-02 11:50:28
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yuraining

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
小小鑫000: 金币+5 2014-07-03 10:58:00
差不多是的,只需要修改INCAR文件里面的优化参数,粗略优化时:
IBRION=3
EDIFF=0.0001
EDIFFG=-0.1
POTIM=0
IOPT = 3,
完成后用vfin.pl命令生成新的POSCAR
再修改
EDIFF=0.00001
EDIFFG=-0.02
IOPT = 1
其中EDIFF和EDIFFG根据自己的体系修改
IOPT的具体算法可以看官网的说明:
http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/optimizers.html
4楼2014-07-02 21:20:20
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