24小时热门版块排行榜    

查看: 2299  |  回复: 5
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

小小鑫000

铁虫 (小有名气)

[求助] 会用vfin.pl这个脚本的高手进来! 已有1人参与

各位前辈,大家好:
最近在用vasp算过渡态时,遇到了vfin.pl 这个脚本,但我不知道它怎么用,当我在计算的当前目录下,运行这个命令时,它出现了error:no output directory given。 这的意思难道是说这个脚本不能在当前目录下运行?那它到底怎么运行?还望大牛们指导呀,不胜感激!
回复此楼
好好研究,天天向上!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小小鑫000

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yuraining at 2014-07-01 19:36:16
vfin.pl 后面应该有一个目录名,这样这一次NEB计算产生的文件都会转移到这个新目录里,原来的00-0n目录里面的就只有新的POSCAR文件了,可以进一步作为NEB计算的输入文件

前辈,谢谢您的指导,那我是不是可以在第一遍粗算过渡态后,只用一下这个命令,别的什么都不用管,来进行下一步精算了?
好好研究,天天向上!
3楼2014-07-02 11:50:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

yuraining

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小小鑫000: 金币+5 2014-07-02 11:32:03
vfin.pl 后面应该有一个目录名,这样这一次NEB计算产生的文件都会转移到这个新目录里,原来的00-0n目录里面的就只有新的POSCAR文件了,可以进一步作为NEB计算的输入文件
2楼2014-07-01 19:36:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yuraining

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
小小鑫000: 金币+5 2014-07-03 10:58:00
差不多是的,只需要修改INCAR文件里面的优化参数,粗略优化时:
IBRION=3
EDIFF=0.0001
EDIFFG=-0.1
POTIM=0
IOPT = 3,
完成后用vfin.pl命令生成新的POSCAR
再修改
EDIFF=0.00001
EDIFFG=-0.02
IOPT = 1
其中EDIFF和EDIFFG根据自己的体系修改
IOPT的具体算法可以看官网的说明:
http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/optimizers.html
4楼2014-07-02 21:20:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

张丽芙

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yuraining at 2014-07-01 19:36:16
vfin.pl 后面应该有一个目录名,这样这一次NEB计算产生的文件都会转移到这个新目录里,原来的00-0n目录里面的就只有新的POSCAR文件了,可以进一步作为NEB计算的输入文件

请问后边这个output directory怎么写呢?
5楼2016-01-18 22:09:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 0XLacIJUOj8D 2026-08-24 3/150 2026-08-25 01:47 by BZKMTicpDhFj
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +7 scalable 2026-08-24 7/350 2026-08-24 23:01 by anata1209
[基金申请] 我面上完蛋了 +9 且听虎啸 2026-08-20 10/500 2026-08-24 20:08 by 苦寒来香
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +21 koalala 2026-08-24 24/1200 2026-08-24 19:25 by 家与远方
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +17 羊腰板 2026-08-21 19/950 2026-08-24 16:52 by iaeyuan
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +13 kulium 2026-08-21 16/800 2026-08-24 16:27 by superceng
[基金申请] 今日不放榜?网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +17 医学老男孩 2026-08-20 21/1050 2026-08-24 14:21 by refreshing11
[基金申请] 朋友圈看到的 +7 wangzilk 2026-08-18 9/450 2026-08-24 10:50 by cmrandy
[基金申请] 让我中一个面上吧! +13 大萍1987 2026-08-20 16/800 2026-08-24 10:23 by 太傻了
[基金申请] 什么时候开奖? +10 CrisMessi 2026-08-18 11/550 2026-08-24 06:50 by 开心的小狮子
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 今天放榜吗? +15 布布和一二 2026-08-19 16/800 2026-08-23 09:55 by 张春生
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +24 yaoyewhu2008 2026-08-20 26/1300 2026-08-22 17:43 by kammury
[基金申请] 时间戳今天,20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 看来今天不会放榜了? +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧? +4 哈哈蛤? 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
信息提示
请填处理意见