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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 会用vfin.pl这个脚本的高手进来！
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小小鑫000

铁虫 (小有名气)

[求助] 会用vfin.pl这个脚本的高手进来！ 已有1人参与

各位前辈，大家好：
最近在用vasp算过渡态时，遇到了vfin.pl 这个脚本，但我不知道它怎么用，当我在计算的当前目录下，运行这个命令时，它出现了error：no output directory given。 这的意思难道是说这个脚本不能在当前目录下运行？那它到底怎么运行？还望大牛们指导呀，不胜感激！
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好好研究，天天向上！
1楼 2014-07-01 18:06:33
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小小鑫000

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by yuraining at 2014-07-01 19:36:16
vfin.pl 后面应该有一个目录名，这样这一次NEB计算产生的文件都会转移到这个新目录里，原来的00-0n目录里面的就只有新的POSCAR文件了，可以进一步作为NEB计算的输入文件

前辈，谢谢您的指导，那我是不是可以在第一遍粗算过渡态后，只用一下这个命令，别的什么都不用管，来进行下一步精算了？
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好好研究，天天向上！
3楼2014-07-02 11:50:28
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yuraining

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小小鑫000: 金币+5 2014-07-02 11:32:03
vfin.pl 后面应该有一个目录名，这样这一次NEB计算产生的文件都会转移到这个新目录里，原来的00-0n目录里面的就只有新的POSCAR文件了，可以进一步作为NEB计算的输入文件
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2楼2014-07-01 19:36:16
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yuraining

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
小小鑫000: 金币+5 2014-07-03 10:58:00
差不多是的，只需要修改INCAR文件里面的优化参数，粗略优化时：
IBRION=3
EDIFF=0.0001
EDIFFG=-0.1
POTIM=0
IOPT = 3，
完成后用vfin.pl命令生成新的POSCAR
再修改
EDIFF=0.00001
EDIFFG=-0.02
IOPT = 1
其中EDIFF和EDIFFG根据自己的体系修改
IOPT的具体算法可以看官网的说明：
http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/optimizers.html
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4楼2014-07-02 21:20:20
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张丽芙

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by yuraining at 2014-07-01 19:36:16
vfin.pl 后面应该有一个目录名，这样这一次NEB计算产生的文件都会转移到这个新目录里，原来的00-0n目录里面的就只有新的POSCAR文件了，可以进一步作为NEB计算的输入文件

请问后边这个output directory怎么写呢？
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5楼2016-01-18 22:09:00
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